Argonaute

Argonaute蛋白质家族是参与RNA干扰（RNAi）的一系列蛋白质，可与siRNA、miRNA与piRNA等小非编码RNA结合，为RNA诱导沉默复合体（RISC）的重要组成部分，RISC可与和其中小RNA序列互补的mRNA，进而促进其降解或抑制其转译，达到基因静默的效果^[1]。此蛋白家族的名称来自扁船蛸的学名（Argonauta argo），因发表者认为AGO1基因突变的阿拉伯芥外形和其相似而得名^[2]。

Argonaute蛋白
激烈火球菌（英语：Pyrococcus furiosus）的Argonaute蛋白（PDB 1U04），其中PIWI结构域位于右侧，PAZ结构域（德语：PAZ-Domäne）位于左侧
鉴定
标志	Argonaute
Pfam	PF02171（旧版）
InterPro（英语：InterPro）	IPR003165
PROSITE（英语：PROSITE）	PS50822
CDD（英语：Conserved Domain Database）	cd02826
现有可用的蛋白结构： Pfam 结构（旧版） / ECOD PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum（英语：PDBsum） 结构概要

Argonaute蛋白Paz结构域（德语：PAZ-Domäne）
鉴定
标志	Paz
Pfam	PF12212（旧版）
InterPro（英语：InterPro）	IPR021103
SCOP（英语：Structural Classification of Proteins）	b.34.14.1 / SUPFAM
现有可用的蛋白结构： Pfam 结构（旧版） / ECOD PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum（英语：PDBsum） 结构概要

Argonaute蛋白质家族的蛋白从N端自C端包含N、L1、PAZ（德语：PAZ-Domäne）、L2、M与PIWI等6个结构域^[3]，其中PAZ结构域（德语：PAZ-Domäne）可识别小RNA3′端的单股突出碱基而与之结合；PIWI结构域有内切酶活性，可负责切割目标mRNA，但也有些Argonaute家族蛋白的PIWI在演化过程中丧失了内切酶的功能。人类基因组共编码8种Argonaute蛋白，其中AGO1－4均可与miRNA结合，但仅AGO2具有内切酶活性^[4]。植物的AGO1参与miRNA介导的mRNA降解，其AGO4则不参与mRNA降解，但与siRNA结合后可启动DNA甲基化等表观遗传调控而抑制目标基因表现^[5]。

应用

2016年，河北科技大学的韩春雨在《自然-生物技术》期刊发表名为NgAgo（英语：NgAgo）的基因编辑技术，使用格氏嗜盐碱杆菌（Natronobacterium gregoryi）的Argonaute蛋白切割DNA，但结果备受质疑，原论文于隔年被期刊撤回^[6]。2017年，伊利诺大学厄巴纳-香槟分校团队使用古菌激烈火球菌（英语：Pyrococcus furiosus）的Argonaute蛋白（PfAgo）为人工限制酶，于体外切割DNA^[7]。