1921年（大正12年）度規劃造艦。最初預定艦名為第四八潛水艦^[1]。
- 10月20日神戶川崎造船所動工
1926年（大正15年）3月30日下水
1927年（昭和2年）3月31日竣工。船籍編入吳鎮守府。竣工時的艦名為伊號第二一潛水艦。
1938年（昭和13年）6月1日改名為伊號第一二一潛水艦。
1941年（昭和16年）太平洋戰爭開戰時與伊號第一二二潛水艦一同配屬至第6潛水戰隊第13潛水隊。
- 12月新加坡以東海面進行布雷作業。
1942年（昭和17年）1月達爾文附近海域に布雷39枚。
- 1月18日擊沉荷蘭貨客船1隻。
- 2月阿拉弗拉海で気象偵察に従事し
- 3月21日返回吳港。為了給偵察夏威夷的二式飛行艇提供補給支援（加油），在夏威夷偵察結束後將機雷庫和敷設筒改造為儲氣罐。
- 8月前往拉包爾
- 8月7日對瓜達爾卡納爾島進行砲撃。
- 9月20日返回吳港做修理。
- 12月21日第二次前往拉包爾，在新幾內亞・ラエ進行運輸任務。
1943年（昭和18年）1月29日支援瓜島撤退行動，之後返回吳港。
- 5月第三次前往拉包爾，在ラエ進行了8次運輸任務。
- 9月1日返回吳港，此後作為訓練潛艇用。
1945年（昭和20年）6月12日返回舞鶴港等待戰爭終結。
- 11月30日除籍。
1946年（昭和21年）4月30日舞鶴海域由美國海軍做海沒処分。

艦歷

歴代艦長