化學分類列表

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化學分類系統試圖將化學元素或化合物依其化學性質或化學結構特性進行分類。結構特性是內在屬性，而化學性質和衍生的分類一定程度上取決於發揮該功能的化學相互作用官能基的類型。有時其準則是純物理的（例如摩爾質量），有時則會用化學層次以上的化學性質來建構化學分類。

有些分類系統會將不同層次的分類混在一起，因此分類的階層會比較模糊，例如在同一層出現結構和性質的分類。若化學性質和其結構緊密相關的場合，例如藥理學特性整合進來時，更容易有此情形，因為定量構效關係多半無法直接只由結構資訊計算。

物理化學

• 依摩爾質量
• 依電荷：不帶電、正電、負電、部份帶電（英語：partial charge）
  • 形式電荷、氧化數
• 溶解度
• PH值（或酸度係數）

依功能特性

• 依官能團
• 依 生物活性（大部份只適用在大生物分子，特別是酶，會依依組成氨基酸的化學結構而定）
  • 配體和受體、輔因子
  • 酶學委員會編號（EC number）
  • TC number（英語：TC number）
  • 藥效團和非藥物
• 通用化學品商業分類（英語：commercial classification of chemicals）^[1]。

混合系統和目錄

• 解剖學治療學及化學分類系統^[2]
• 基因本體
• 全球化學品統一分類和標籤制度
• ChEBI

歷史

• Döbereiner三元素組（英語：Döbereiner's triads）