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尼爾菌屬

芽孢杆菌科的一属细菌 来自维基百科,自由的百科全书

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尼爾菌屬學名Niallia,或譯尼爾屬)是芽孢桿菌目芽孢桿菌科的一種革蘭氏陽性桿狀細菌。[3][4] 該屬的模式種環狀尼爾菌Niallia circulans)。

事实速览 尼爾菌屬, 科學分類 ...

尼爾菌屬的成員以前是屬於芽孢桿菌屬的物種,由於以前用於將物種劃分到該進化枝的標準不明確,[5][6] 科學界長期以來認為該屬表現出廣泛的多系和系統發育異質性。已經發表了多項使用比較系統發育分析的研究,試圖闡明芽孢桿菌屬物種之間的進化關係,從而建立了許多新的屬,例如嗜鹼鹽芽孢桿菌屬Alkalihalobacillus)、短芽孢桿菌屬Brevibacillus)、土壤芽孢桿菌屬Solibacillus)、脂環酸芽孢桿菌屬Alicyclobacillus)、枝芽孢桿菌屬(Virgibacillus)和艾雯絲/埃文斯氏菌屬英語EvansellaEvansella)。[7][8][9][10][11][3] 此外,芽孢桿菌屬已被限制為僅包括與枯草芽孢桿菌蠟樣芽孢桿菌密切相關的物種。[7][3]

細菌屬「Niallia」的名字以英國微生物學家尼爾·A·洛根(Niall A. Logan)教授(格拉斯哥卡利多尼亞大學)的名字命名,以表彰他對芽孢桿菌屬成員的分類和用途做出的諸多貢獻。[3]

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生化特徵和分子特徵

該屬成員均為兼性厭氧生物,存在於土壤、污水、食物和人類糞便等多種環境中。所有成員均能運動並產生內生孢子。尼爾菌屬的最佳生長溫度為30—37°C。 環狀尼爾菌是一種重要的細菌,用於水產養殖、生物修復、水處理和酶生產。它也是一種機會性病原體,可導致免疫功能低下患者發生敗血症。在蛋白質GAF結構域蛋白和DNA連接酶D中,已鑑定出兩個該屬獨有的保守特徵的插入/缺失(刪除)英語Conserved signature indels(CSI),在大多數情況下,它們由該屬的所有或大多數成員獨有。[3] 這些CSI是通過分析尼爾菌屬物種的基因組序列而確定的,並提供了一種可靠的方法,可以從分子角度將尼爾菌屬與其它芽孢桿菌科下的屬和細菌區分開來。[3]

分類學

截至2021年5月,尼爾菌屬共包含5個具有有效發布名稱的物種。[1][2] 在研究芽孢桿菌屬內部分類關係的研究中,該屬被鑑定為一個單系進化枝,並且在系統發育上與其他芽孢桿菌屬的物種無關。[3]基因組分類學數據庫(GTDB)中也觀察到了這種分支模式。[12]

還發現一種未有效發表的物種「Bacillus tuaregi(圖阿雷格芽孢桿菌)」在系統發育樹中與尼爾菌屬的其他成員分組,並以保守特徵插入缺失(CSI)的形式共享相同的分子標記。[3] 然而,由於缺乏培養菌株信息,該屬的轉移並未正式提出。隨着更多基因組和新物種的發現和歸屬,該屬需要進一步修訂。

系統發育

基於16S rRNA LTP_10_2024[13][14][15] 基於120種標記蛋白 GTDB 09-RS220[16][17][18]

Bacillus benzoevorans Pichinoty, Asselineau & Mandel 1987

Niallia

N. endozanthoxylica (Ma et al. 2017) Gupta et al. 2020

N. oryzisoli (Zhang et al. 2016) Gupta et al. 2020

N. circulans (Jordan 1890) Gupta et al. 2020

N. nealsonii (Venkateswaran et al. 2003) Gupta et al. 2020

N. taxi (Tuo et al. 2020) Gupta et al. 2020

Bacillus_BD

Bacillus benzoevorans

Niallia endozanthoxylica (Ma et al. 2017) Gupta et al. 2020

"Bacillus tuaregi" Cadoret et al. 2017

Niallia

N. taxi

N. nealsonii

"N. alba" Thorat et al. 2022

N. circulans

參閱

參考文獻

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