恩格貝鎮下轄以下村級行政區劃單位^[2]：

新圪旦村、​烏蘭村、​北海村、​柳子圪旦村、​蒲圪卜村、​武大倉村、​黃母哈日村、​牛場梁村、​茶窯溝村、​元寶灣村、​查乾溝村、​呼斯圖村、​哈拉亥圖村、​耳字溝村和​補錄梁村。