據2009年《新編諸子集成續編叢書 出版者言》稱，「叢書原擬分兩輯出版，第一輯擬目三十多種，後經過調整，確定為四十種，今年將全部出齊。第二輯原來只有一個比較籠統的規劃，受各種因素限制，在實施過程中不斷發生變化，有的項目已經列入第一輯出版，因此我們後來不再使用第一輯的提法，而是統名之為新編諸子集成。」[2]
以下為該輯書目。「首版出版時間」指該書中華書局第一版出版時間。有些圖書首版出版於收入本集成前，後被中華書局收入本集成，但其首版仍為原首版出版時間，並列印於版權頁上，故下表相應註明「收入集成時間」。
更多信息 編號, 書名 ...
| 編號 |
書名 |
作者 |
點校/整理者 |
首版出版時間 |
備註 |
收入集成時間
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| 1 |
論語集釋 |
程樹德撰 |
程俊英 蔣見元點校 |
1990年 |
全4冊 |
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| 2 |
孟子正義 |
焦循撰 |
沈文倬點校 |
1987年 |
全2冊 |
1991年
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| 3 |
四書章句集注 |
朱熹撰 |
鍾哲點校 |
1983年 |
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| 4 |
荀子集解 |
王先謙撰 |
沈嘯寰 王星賢點校 |
1988年 |
全2冊 |
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| 5 |
墨子間詁 |
孫詒讓撰 |
孫以楷點校 |
1986年 |
全2冊 |
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| 孫啟治點校 |
2001年 |
全2冊
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| 6 |
墨子校注 |
吳毓江撰 |
孫啟治點校 |
1993年 |
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| 7 |
墨辯發微 |
譚戒甫撰 |
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1964年 |
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1986年
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| 8 |
墨子城守各篇簡注 |
岑仲勉撰 |
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1958年 |
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1986年
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| 9 |
老子道德經注 |
王弼撰 |
樓宇烈校釋 |
2008年 |
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| 10 |
老子校釋 |
朱謙之撰 |
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1963年 |
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1983年
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| 11 |
帛書老子校注 |
高明撰 |
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1996年 |
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| 12 |
莊子集釋 |
郭慶藩撰 |
王孝魚點校 |
1961年 |
全4冊 |
1982年
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| 13 |
莊子集解 |
王先謙撰 |
沈嘯寰點校 |
1987年 |
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| 莊子集解內篇補正 |
劉武撰 |
沈嘯寰點校
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| 14 |
列子集釋 |
楊伯峻撰 |
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1979年 |
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1985年
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| 15 |
管子校注 |
黎翔鳳撰 |
梁運華整理 |
2004年 |
全3冊 |
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| 16 |
管子輕重篇新詮 |
馬非百撰 |
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1979年 |
全2冊 |
1986年
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| 17 |
商君書錐指 |
蔣禮鴻撰 |
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1986年 |
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| 18 |
韓非子集解 |
王先慎撰 |
鍾哲點校 |
1998年 |
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| 19 |
公孫龍子懸解 |
王琯撰 |
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1992年 |
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| 20 |
公孫龍子形名發微 |
譚戒甫撰 |
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1963年 |
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1986年
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| 21 |
十一家注孫子校理 |
孫武 撰
曹操等 注
楊丙安 校理 |
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1999年 |
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| 22 |
呂氏春秋集釋 |
許維遹撰 |
梁運華整理 |
2009年 |
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| 23 |
晏子春秋集釋 |
吳則虞撰 |
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1962年 |
全2冊 |
1982年
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| 24 |
孫臏兵法校理 |
張震澤撰 |
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1984年 |
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1986年
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| 25 |
新語校注 |
陸賈撰
王利器校注 |
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1986年 |
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| 26 |
新書校注 |
賈誼撰
閻振益 鍾夏 校注 |
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2000年 |
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| 27 |
淮南鴻烈集解 |
劉文典撰 |
馮逸 喬華 點校 |
1989年 |
全2冊 |
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| 28 |
淮南子集釋 |
何寧撰 |
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1998年 |
全3冊 |
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| 29 |
鹽鐵論校注（定本） |
王利器撰 |
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1992年 |
全2冊 |
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| 30 |
春秋繁露義證 |
蘇輿撰 |
鍾哲 點校 |
1992年 |
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| 31 |
法言義疏 |
汪榮寶撰 |
陳仲夫 點校 |
1987年 |
全2冊 |
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| 32 |
太玄集注 |
揚雄 撰
司馬光 集注 |
劉韶軍 點校 |
1998年 |
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| 33 |
白虎通疏證 |
陳立撰 |
吳則虞 點校 |
1994年 |
全2冊 |
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| 34 |
潛夫論箋校正 |
王符 撰
汪繼培 箋
彭鐸 校正 |
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1985年 |
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| 35 |
論衡校釋（附劉盼遂集解） |
黃暉撰 |
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1990年 |
全4冊 |
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| 36 |
抱朴子內篇校釋（增訂本） |
王明著 |
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1980年 |
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1985年
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| 37 |
抱朴子外篇校箋 |
楊明照撰 |
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1991年（上）
1997年（下） |
全2冊 |
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| 38 |
顏氏家訓集解 |
王利器撰 |
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1993年 |
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| 39 |
文子疏義 |
王利器撰 |
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2000年 |
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| 40 |
劉子校釋 |
劉晝著
傅亞庶 校釋 |
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1998年 |
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