Pfam

Pfam是一個蛋白質家族資料庫。此資料庫會利用隱馬爾可夫模型進行多重序列比對以及加上蛋白腳註^[1][2][3]。

Pfam

內容
說明（描述）	The Pfam database provides alignments and hidden Markov models for protein domains.
獲取的數據類型	Protein families
有機體（生物）	全部
相關信息
研究中心	WTSI（英語：Wellcome Trust Sanger Institute）
主要參考文獻（引用）	PMID 19920124
訪問
數據格式	Stockholm format（英語：Stockholm format）
網站	Pfam
下載網址	Pfam ftp[永久失效連結] Pfam ftp
其它信息
許可	GNU寬通用公共許可證
可否列為書籤	yes

特色

Pfam中所登錄的每一個蛋白質家族可以：

• 查詢多重序列比對
• 查看蛋白質主要結構
• 檢視物種演化樹
• 連結其他資料庫
• 查看已知的蛋白質結構

Pfam內的蛋白質家族描述由維基百科使用者管理。

Pfam的最新版本是「Pfam 34.0」（2021年3月，共計19,179個家族）^[4]

參見

• TrEMBL Database performing an automated protein sequence annotation
• InterPro（英語：InterPro） Integration of protein domain and protein family databases
• PDBfam（頁面存檔備份，存於網際網路檔案館） — thorough assignment of Pfam domains to sequences in the Protein Data Bank (PDB)^[5][6]