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歐洲生物資訊研究所

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歐洲生物資訊研究所(英語:European Bioinformatics Institute縮寫EBI),全稱歐洲分子生物學實驗室-歐洲生物資訊研究所European Molecular Biology Laboratory-European Bioinformatics Institute,縮寫:EMBL-EBI),是一個政府間組織(IGO),作為歐洲分子生物學實驗室(EMBL)的一部分,專注於生物資訊科學領域的研究和服務。它位於劍橋附近欣克斯頓英語Hinxton惠康基因組園區英語Wellcome Genome Campus,擁有超過600名全職英語Full-time equivalent員工。[4]



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歐洲生物資訊研究所

歐洲生物資訊研究所為科學界提供免費生物資訊資源、促進基礎研究、提供培訓和傳播行業尖端技術。歐洲生物資訊研究所管理和維護着多個大型生物資訊公共資料庫, 跨基因組學,蛋白質組學,化學資訊科學,轉錄組學,系統生物學等,同時建立了多種工具供讓研究人員分析和分享資訊。歐洲生物資訊研究所提供最優質的研究環境、無數跨學科的合作機會以及遍及世界各地的培訓課程。

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主要任務

  1. 為科學界建立和維護生物學資料庫, 提供免費的資料和生物資訊服務, 支援生物學資料的儲存和挖掘,促進科技進步;
  2. 通過生物資訊科學的基礎研究繼續推動生物學發展;
  3. 為各個層次的科學工作者提供生物資訊科學培訓;
  4. 支援幫助邊緣尖端科技成果向工業界的轉化;
  5. 協調歐洲生物資料的提供。

主要服務

歐洲生物資訊研究所擁有超過20年生物資訊科學研究和服務經驗,是全球收集和傳播生物資料、提供免費生物資訊服務的歐洲節點。該所管理維護着世界最全面的分子生物資料庫,其中很多是生物學家熟悉的資料庫,例如核酸序列資料庫(ENA),基因組基因表現資料UniProt蛋白質資料庫,InterPro(蛋白質家族/域/蛋白指紋等)和PDBe(大分子結構)。ENA由原EMBL-Bank核酸序列資料庫基礎上發展起來,是歐洲最重要的核酸序列資源,與美國NCBIGenBank和日本的日本DNA資料庫(DDBJ)組成國際核酸序列資料庫合作聯盟(INSDC)。這三大數據庫各自收錄了世界上所報道的所有序列資料的一部分,並且每天即時更新交換各自的序列資訊。

歐洲生物資訊研究新的資料資源包括蛋白質相互作用(IntAct),反應途徑(Reactome)、小分子(ChEBI)等等,能幫助研究人員了解構建一個有機體的分子部分,以及這些部件如何結合起來建立系統。其它還包含文獻資料庫、專利資料資源、BioModels Database基因本體等等。每個資料庫的細節有所不同,但都堅持相同的服務原則。

歐洲生物資訊研究所向全球提供免費的生物資訊服務,發展和維護着多種用於瀏覽、檢索、分析處理生物資料的工具服務。資料取得工具SRS(序列檢索系統)為用戶提供了快速、便捷和友好的介面以搜尋超過200個局域和公眾資料庫中大量不同種類的生命科學類資料。序列資料搜尋包括FASTA、 NCBI BLAST和WU-BLAST序列同源性和相似性對比工具。其它還包括蛋白功能分析,序列多重排比,前進演化樹分析,大分子結構分析與多維顯示等。

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研究興趣

歐洲生物資訊研究所為生物資訊科學提供了一個優質而獨特的研究環境。該所研究興趣廣泛,研究與服務相輔相成。作為一個EMBL不可分割的一部分, 歐洲生物資訊研究所是EMBL的活躍研究成員。研究小組旨在通過研究開發新方法來解釋闡述生物資料,了解其生物學的意義。服務隊伍在維護和加強現有資料資源的同時研究開發新的服務內容。

參閱

參考文獻

外部連結

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