α-变形菌（Alphaproteobacteria）是变形菌门（Proteobacteria）下的一个纲[3]。此纲的成员变异性极大，且共通点极少，但他们确实系出同源。α-变形菌大多都是革兰氏阴性菌，而有些包内寄生的物种缺少肽聚糖，而造成革兰氏染色变异。[3][4]
Quick Facts α-变形菌纲, 科学分类 ...
α-变形菌纲
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穿透式电子显微镜下的昆虫细胞，细胞被沃尔巴克体（Wolbachia）感染
授权：Public Library of Science / Scott O'Neill
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科学分类 
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| 域：
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细菌域 Bacteria
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| 门：
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假单胞菌门 Pseudomonadota
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| 纲：
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α-变形菌纲 Alphaproteobacteria
Garrity et al. 2006
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| 亚纲
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- Magnetococcidae
- Rickettidae
- 立克次体目 Rickettsiales
- Anaplasmataceae
- Midichloriaceae
- Rickettsiaceae
- Pelagibacterales
- Caulobacteridae
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α-变形菌包含多种细菌，其中包含光自营细菌、植物共生菌（如根瘤菌）、内共生细菌（如Wolbachia），和胞内寄生细菌（如立克次体）。
此外，本纲还包含已灭绝的Proto-mitochondrion。真核生物的祖先摄入了此种细菌，进行内共生作用，成为后来的线粒体[2]。还有一种生物技术上很喜欢使用的农杆菌（Rhizobium radiobacter）也是本纲成员，科学家常常使用本物种来将外来DNA导入植物基因体中。[5]另外，一些光自营生物像是遍在远洋杆菌（Pelagibacter ubique）也属于此纲，α-变形菌的微生物可能占了海洋微生物的10%左右。
关于本纲所属的目，有人反对现行的分类法，尤其是Pelagibacterales的地位，但大体上大家还是普遍接受。细菌的分类学一直是分类学家相当头痛的问题，因为细菌的基因会彼此互相交流，且基因歧异度相当高（像是遍在远洋杆菌由于他的寄生行为，就会精简化他的基因体）。在某些目中，其成员的GC含量变异也大的夸张[2]。举个例子，像是Pelagibacterales、立克次体目（Rickettsiales）和Holosporales三者的基因体都含有高AT含量，有人认为那其实是趋同演化所导致的假象[6][7][8]，而反对方也有他们自己的论述[2][9][10][11]。后来有人发现用以判断分类依据的rRNA中，GC含量好像好像不太会受基因体变异影响。因此，rRNA中GC含量较高的 Holosporales 就被和低GC含量的Pelagibacterales和立克次体目分开了[2]。
α-变形菌纲下有三个亚纲Magnetococcidae、立克次体亚纲（Rickettsidae）和柄杆菌亚纲（Caulobacteridae）[2]。基群为Magnetococcidae，此类别包含了许多趋磁细菌（由于趋磁细菌为多系群，因此只有部分包含于α-变形菌之下）[12]立克次体亚纲则由细胞内寄生的立克次体目（Rickettsiales），以及可以在胞外单独生存的Pelagibacterales。柄杆菌亚纲则由Holosporales、红螺旋菌目（Rhodospirillales）、鞘脂单胞菌目（Sphingomonadales）、红细菌目（ Rhodobacterales）、柄杆菌目（Caulobacterales）、Kiloniellales、Kordiimonadales、短小盒菌目（Parvularculales），和Sneathiellales。
α-变形菌纲包括以下亚纲：
- Magnetococcidae亚纲
- Rickettidae亚纲
- 立克次体目 Rickettsiales
- Anaplasmataceae
- Midichloriaceae
- Rickettsiaceae
- Pelagibacterales
- Caulobacteridae亚纲
- 全孢菌目 Holosporales Szokoli et al. 2020
- 柄杆菌目 Caulobacterales
- 短小盒菌目 Parvularculales
- 根瘤菌目 Rhizobiales
- 红杆菌目 Rhodobacterales Garrity et al. 2006
- Neomegalonemataceae Hördt et al. 2020
- 副球菌科 Paracoccaceae Liang et al. 2022
- 玫瑰杆菌科 Roseobacteraceae Liang et al. 2021
- 红螺菌目 Rhodospirillales
- 红杆菌科 Acetobacteraceae
- 红螺菌科 Rhodospirillaceae
- 其他红螺菌目未分类成员[2]
- 斯尼思氏菌目 Sneathiellales
- 鞘脂单胞菌目 Sphingomonadales
- 赤杆菌科 Erythrobacteraceae
- Sphingomonadaceae
- 基尔菌目 Kiloniellales
- 基尔菌科 Kiloniellaceae
- Kopriimonas
- 红弧菌属 Rhodovibrio
- Pelagibius[2]
- 柯迪单胞菌目 Kordiimonadales Kwon et al. 2005
- 红海菌目 Rhodothalassiales [2]
以下表格是根据美国国家生物技术信息中心（NCBI）[4][14]
而树状图则是根据'The All-Species Living Tree' Project所提供的16s rRNA分析结果[15]
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?Aquaspirillum polymorphum ♠ (Williams and Rittenberg 1957) Hylemon et al. 1973
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?Furvibacter ♠ Lee et al. 2007
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?Kopriimonas byunsanensis ♠ Kwon et al. 2005
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?Magnetococcus marinus Bazylinski et al. 2012 (in press)
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?Micavibrio aeruginosavorus ♠ Lambina et al. 1983
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?Polymorphum gilvum ♠ Cai 2010
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?Reyranella massiliensis Pagnier et al. 2011
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?Ronia tepidophila ♠
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?Subaequorebacter tamlense ♠ Lee 2006
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?Tuberoidobacter mutans ♠
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?Vibrio adaptatus Muir et al. 1990
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?Vibrio cyclosites Muir et al. 1990
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Rhodovibrio
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红螺菌科 Rhodospirillaceae 2
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Tistrella
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红螺菌科 Rhodospirillaceae 3
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红螺菌科 Rhodospirillaceae 4
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Defluviicoccus vanus Maszenan et al. 2005
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Brenner, Don J.; Krieg, Noel R.; Staley, James T. George M. Garrity , 编. The Proteobacteria. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology 2C 2nd. New York: Springer. July 26, 2005: 1388 [1984(Williams & Wilkins)] [2014-11-08]. ISBN 978-0-387-24145-6. British Library no. GBA561951. （原始内容存档于2015-02-19）. Chilton MD, Drummond MH, Merio DJ, Sciaky D, Montoya AL, Gordon MP, Nester EW., Stable incorporation of plasmid DNA into higher plant cells: the molecular basis of crown gall tumorigenesis, Cell. 1977 Jun;11(2):263-71.
J. Cameron Thrash, Alex Boyd, Megan J. Huggett, Jana Grote, Paul Carini, Ryan J. Yoder, Barbara Robbertse, Joseph W. Spatafora, Michael S. Rappé, Stephen J. Giovannoni. Phylogenomic evidence for a common ancestor of mitochondria and the SAR11 clade. Scientific Reports. 2011, 1: 13 [2019-02-12]. ISSN 2045-2322. PMC 3216501 
. PMID 22355532. doi:10.1038/srep00013. （原始内容存档于2019-10-15）. Bazylinski DA, Williams TJ, Lefèvre CT, Berg RJ, Zhang CL, Bowser SS, Dean AJ, Beveridge TJ. (2012) Magnetococcus marinus gen. nov., sp. nov., a marine, magnetotactic bacterium that represents a novel lineage (Magnetococcaceae fam. nov.; Magnetococcales ord. nov.) at the base of the Alphaproteobacteria. Int J Syst Evol Microbiol. doi: 10.1099/ijs.0.038927-0
