基因组岛 - Wikiwand
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基因组岛

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基因组岛(英语:Genomic islandGI)是指一个基因组中,有证据显示可能来源于基因水平转移的一段[1]。这一术语通常用于描述微生物,特别是细菌的基因组。GI中的基因可以编码多种功能的蛋白质,可以参与细菌共生或病理过程,并且可以帮助微生物适应环境。许多次类地理信息系统存在的基于功能,赋予他们的。例如,和病原微生物发病机制相关的GI通常被称为致病岛(Pathogenicity island,PAI,或译为毒力岛),带有许多抗生素抗性基因的GIs通常被称作抗生素抗药性岛(antibiotic resistance island,简称抗药岛)。相同的GI可以通过各种基因水平转移方式(如转化转导接合)而出现在亲缘关系较远的微生物基因组中,这使得科学家可以通过碱基CG含量比的不同,以及系统发生树分析找出基因组岛。

例子

在许多细菌的基因组中,III型分泌系统和IV型分泌系统都位于基因组岛上。

另见

参考文献

  1. ^ Langille, MG; Hsiao, WW; Brinkman, FS. Detecting genomic islands using bioinformatics approaches.. Nature Reviews. Microbiology. May 2010, 8 (5): 373–82. PMID 20395967. doi:10.1038/nrmicro2350. 

外部链接

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基因组岛
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