普通细菌孔道蛋白家族

普通细菌孔道蛋白是一类（英语：Protein family）存在于革兰氏阴性菌外膜上的蛋白质。这类蛋白充当了对亲水性物质的分子过滤器^[1]，在外膜上起着“分子筛”的作用。这些蛋白生成的装满水的通道可让亲水性物质进入周质空间中。部分孔道蛋白生成的扩散通路可允许大小小于排阻极限的溶质通过，而另一些则在孔道内有特异性的结合位点，只能允许一种溶质通过。孔道蛋白是细菌外膜上的一种主要蛋白质，噬菌体和细菌素（英语：Bacteriocin）常常会通过它们与细菌结合。

革兰氏阴性菌孔道蛋白
鉴定
标志	Porin_1
Pfam	PF00267（旧版）
Pfam宗系	CL0193（旧版）
InterPro（英语：InterPro）	IPR001702
PROSITE（英语：PROSITE）	PDOC00498
SCOP（英语：Structural Classification of Proteins）	1mpf / SUPFAM
TCDB（英语：TCDB）	1.B.1
OPM（英语：Orientations of Proteins in Membranes database）家族	31
OPM（英语：Orientations of Proteins in Membranes database）蛋白	1pho
CDD（英语：Conserved Domain Database）	cd01345
现有可用的蛋白结构： Pfam 结构（旧版） / ECOD PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum（英语：PDBsum） 结构概要 PDB 2fgrA:21-351 2fgqX:20-351 1pho :27-351 1iivA:27-378 1osmA:27-363 1opfD:28-362 1mpf :28-362 2omf :28-362 1gfm :28-362 1hxuA:28-362 1gfp :28-362 1gfq :28-362 1hxxA:28-362 1bt9A:28-362 1gfo :28-362 1gfn :28-362 1hxtA:28-362

细菌孔道蛋白常常会结合成三聚体（英语：Protein trimer）。而它们的β链则是这些蛋白质的跨膜核心^[2]。有证据表明^[3]一些孔道蛋白与净化有关。这些蛋白质有：

• Enterobacteria PhoE, OmpC, OmpF, NmpC.
• Bacteriophage PA-2 LC.
• Neisseria PI.A, PI.B

亚家族

• Porin, Neisseria sp. type IPR002299

参考

1. Benz R, Bauer K. Permeation of hydrophilic molecules through the outer membrane of gram-negative bacteria. Review on bacterial porins. Eur. J. Biochem. 1988, 176 (1): 1–19. PMID 2901351. doi:10.1111/j.1432-1033.1988.tb14245.x.
2. Jap BK, Walian PJ. Biophysics of the structure and function of porins. Q. Rev. Biophys. 1990, 23 (4): 367–403. PMID 2178269. doi:10.1017/S003358350000559X.
3. Pattus F, Jeanteur D, Lakey JH. The bacterial porin superfamily: sequence alignment and structure prediction. Mol. Microbiol. 1991, 5 (9): 2153–2164. PMID 1662760. doi:10.1111/j.1365-2958.1991.tb02145.x.