系统发生学
研究生物之间的亲缘关系和演化规律的学科 / 维基百科,自由的 encyclopedia
系统发生学(英语:phylogenetics)又称种系发生学、谱系发生学、亲缘关系学,简称谱系学或发生学,是研究及推理生物个体或群体(例如物种或种群)间演化史及关系的科学方法,属于系统分类学[注 1]的一部分。
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系统发生学的推理方法,通常在性状演变的特定模型下,评估可观察到的遗传性状(例如DNA序列或生物形态)来“假定”这些生物间的关系。这种分析推理方法的结果,就是系统发生(phylogeny)[注 2],也称为系统发生树(phylogenetic tree)——可显示一群生物演化史的关系图解假说[3]。系统发生树的尖端可以是生物体或化石,且代表演化谱系中的现今生物或“末端”生物。
利用系统发生学来分析种系的基本原则是:两个演化支具有“相同的性状状态”是它们对于“共有祖先同一状态”的保留;而现存生物的性状就是演化史的纪录,可作为重建演化史的依据。由系统发生分析的原则,建构了支序分类学的基本逻辑;而系统发生分析已成为理解生物多样性、演化、生态学和基因组的核心。
系统发生学这个概念不单止用于生物种系的发生与发展,还会用在系统分类学各个层面的分类单元上面。它也会被用到某一性状在种系发生过程中的演化这一方面。