亞佛加厥 (軟體)

亞佛加厥（英語：Avogadro）是一個分子編輯軟體，是一款自由軟體，被設計用於計算化學，分子建模，生物化學，材料科學， 以及相關領域的跨平台軟體^[1][2][3][4]。並且提供添加外掛程式，附加元件或外掛程式的功能^[5]。其名稱是以義大利化學家亞佛加厥命名的。

關於與「亞佛加厥」同名的其他主題，請見「亞佛加厥 (消歧義)」。

Avogadro

首次釋出	2009年10月23日 (2009-10-23)
目前版本	1.1.1（2013年12月11日 (2013-12-11)）
預覽版本	Avogadro 2：0.8.0（2015年8月17日 (2015-08-17)）
原始碼庫	github.com/OpenChemistry/avogadroapp
程式語言	C++ (Qt)
作業系統	Linux, Mac OS X, Microsoft Windows
授權條款	Avogadro 1：GNU通用公眾授權條款 Avogadro 2：3句版BSD授權條款
網站	avogadro.openmolecules.net

特點

使用Avogadro繪製氯雷他定的空間填充模型。

• 分子構造/編輯器可在Windows， Linux和Mac OS X三種平台上運作。
• 所有的原始碼皆發佈於GNU GPL（Avogadro 2則改用3句版BSD授權條款授權）。
• 支援多國語言，目前有翻譯成中文、法語、德語、義大利語、俄語和西班牙語（預設語言為英文）。
• 支援多執行緒彩現和計算。
• 外掛程式架構的開發，包括彩現、互動式工具、命令、和Python指令碼。
• 能openbabel匯入檔案，輸入生成多種計算化學程式產生的封包、晶體和生物分子。

歷史

2007年5月17日發表了Avogadro，為第一次正式公測，也是該軟體首個發佈的版本，0.1.0版，截至2009年6月，已發布到0.9.8版，當時就已經包含了很完整的功能。

2009年6月12日，Avogadro被開源發表於Qt。6月23日，Avogadro榮獲SourceForge社區選 擇獎「院士項目」的獎項。10月23日，Avogadro改版並發布1.0正式版，並使用GNU GPLv2條款^[6]。目前最新版本是1.1.1。

2013年4月11日，Avogadro專案釋出Avogadro 2的首個測試版本，其成為Open Chemistry軟體套裝的一部份^[7]，與其他兩個軟體可以一起使用，也能分開執行，使用Qt4重新編寫代碼，並加入了一系列的新功能，且改為使用3句版的BSD授權條款授權。

功能

基本功能為分子編輯，建立及構造，並可選擇週期表上任意元素，透過更改元素資料庫，甚至能添加一些新的元素，如:電子偶素與渺子偶素。另外，程式附有自動加上氫功能，能依據酸鹼值添加氫原子，並附有分子結構最適化功能，能依據價電子排斥理論或分子軌域理論進行計算分子結構。

令外有額外的分子力學、生物化學、光譜學等功能，但是要先自行準備資料庫方可使用。

程式有內附測量功能，可測得鍵角與鍵長等分子物理量，並且能找出其分子的所有異構物。

缺點

由於資料庫資料有限，因此作出的分子結構會與實際值有所誤差，因此，使用軟體作出的一些數據僅供參考，應以實際實驗為主，軟體僅作為輔助功用。

例子

正丙硫醇的球棒模型

例如要製作一個丙硫醇，只需現任意將三個碳連接起來，在使用內附的加上氫功能，然後在任意碳上接一個硫，最後再使用分子結構最適化，程式會依據分子力學、元素資料、電負度、孤對電子數等資訊用不同的模型計算出最接近真實的分子結構。

三個碳	三個碳加上氫	分子結構最適化

相關條目

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