小蝙蝠是小翼手亞目或小蝙蝠亞目（學名：Microchiroptera）的通稱，以前被視為翼手目中的一個亞目，現已成為一個被棄用的分類單元。以往會將蝙蝠依其體型分為大翼手亞目及小翼手亞目，但此分類不符合分子的相關證據。依最新的研究結果，蹄鼻蝠科和其他果蝠會分類在陰翼手亞目（Yinpterochiroptera）中，至於其他以往分在小蝙蝠亞目的蝙蝠則會分類在陽翼手亞目（Yangochiroptera）中。
快速預覽 小翼手亞目, 科學分類 ...
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| 湯森大耳蝠 Corynorhinus townsendii
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| 界：
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動物界 Animalia
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| 門：
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脊索動物門 Chordata
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| 綱：
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哺乳綱 Mammalia
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| 演化支：
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獸形類 Theriimorpha
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| 演化支：
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獸型類 Theriiformes
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| 演化支：
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枝獸類 Trechnotheria
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| 演化支：
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歧獸類 Cladotheria
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| 演化支：
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原磨楔齒類 Prototribosphenida
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| 演化支：
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純獸類 Zatheria
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| 演化支：
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磨楔齒類 Tribosphenida
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| 亞綱：
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獸亞綱 Theria
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| 下綱：
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真獸下綱 Eutheria
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| 演化支：
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有胎盤類 Placentalia
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| 高目：
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北方真獸高目 Boreoeutheria
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| 總目：
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勞亞獸總目 Laurasiatheria
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| 演化支：
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有陰囊類 Scrotifera
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| 演化支：
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翼手類 Apo-Chiroptera
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| 目：
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翼手目 Chiroptera
Dobson, 1875
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- 鞘尾蝠總科 Emballonuroidea
- 鼠尾蝠總科 Rhinopomatoidea
- 蹄鼻蝠總科 Rhinolophoidea
- 蝙蝠總科 Vespertilionoidea
- 犬吻蝠總科 Molossoidea
- 長腿蝠總科 Nataloidea
- 兔唇蝠總科 Noctilionoidea
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