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鄰近連接法

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邻接法
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鄰近連接法(英文:neighbor-joining method;又稱 NJ 法),生物資訊學術語,是一種用於構建系統發生樹(演化樹)的快速聚類方法,由日本遺傳學家齋藤成也平文式羅馬字:Saitou Naruya)和日裔美國生物學家根井正利(Nei Masatoshi)二人在1987年創立[2]。使用鄰近連接法構建演化樹時,通常需要基於 DNA 序列蛋白質數據,以此了解每對分類單元之間的距離,透過確定距離最近(或相鄰)的成對分類單元使演化樹的總距離達到最小,循環地將相鄰點合併成新的點,最終形成完整的樹型[3][4]

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2002年日本國立遺傳學研究所學者齋藤成也根據世界上18個人類族群的23種遺傳訊息,以鄰近連接法估算而成的遺傳距離分支圖[1]

鄰近連接法不需要關於分子鐘的假設,不考慮任何優化標準,基本思想是進行類的合併時,不僅要求待合併的類是相近的,而且要求待合併的類遠離其他的類,從而透過對完全沒有解析出的星型演化樹進行分解,來不斷改善星型演化樹[5]

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參閱

參考文獻

外部連結

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