本科包括以下屬：

博氏藻科 Borziaceae Borzì 1914
束鞘藻科 Coleofasciculaceae
藍藻科 Cyanothecaceae
Garwoodiaceae
- Botomaella Korde 1958
  - Botomaella decipiens (Korde 1973) Molinari and Guiry 2021^[1]
  - Botomaella zelenovi Korde 1958
- Cayeuxia Frollo 1938
- Garwoodia Wood 1941
  - Garwoodia bardosi Dragastan 1985^[2]
  - Garwoodia fluegelii Dragastan 1985
  - Garwoodia gregaria (Nicholson 1888) Wood 1941
- Ortonella Garwood 1914
  - Ortonella furcata Garwood 1914
  - Ortonella lemoineae Dragastan 1971
- Ortonellopsis Vachard and Cózar 2016
  - Ortonellopsis laxa Vachard and Cózar 2016^[3]
- Paraortonella Dragastan 1985
  - Paraortonella getica Dragastan 1985
  - Paraortonella richteri Dragastan 1985
- Scotlandella Dragastan 1985
  - Scotlandella alpina Dragastan 1985
  - Scotlandella nodosa Dragastan 1985
- Zonotrichites Bornemann 1887
戈芒藻科 Gomontiellaceae
Gomontielloideae
- 發毛針藻屬 Crinalium
- Cyanarcus
- Gomontiella
- Starria
Hormoscilloideae
- Hormoscilla
- Katagnymene
鬚藻科 Homoeotrichaceae Elenkin 1949
微鞘藻科 Microcoleaceae (Hansgirg 1889) Komárek et al. 2014
顫藻科 Oscillatoriaceae Engler 1898
席藻科 Phormidiaceae
- 微鞘藻亞科 Microcoleoideae
  - 水鞘藻屬 Hydrocoleum
  - 鞘絲藻屬 Lyngbyopsis
  - 微鞘藻屬 Microcoleus
  - 束絲藻屬 Sirocoleum
  - Symplocastrum
- 席藻亞科 Phormidioideae
偽魚腥藻科 Pseudanabaenaceae
Heteroleibleinoideae
- Heteroleibleinia
- Sokolovia
- 微絲藻屬 Tapinothrix
- 偽項圈藻亞科 Pseudanabaenoideae
- Arthronema
- Geitlerinema
- Jaaginema
- Leibleinia
- 瘦鞘絲藻屬 Leptolyngbya
- 湖生藍絲藻屬 Limnothrix
- Planktolyngbya
- 偽項圈藻屬 Pseudanabaena
- 羅氏藻屬 Romeria
裂鬚藻科 Schizotrichaceae

科的地位未定的屬：

Atractella Printz 1921
Chthonoblastus Kützing 1843
Hillbrichtia
Jasser et al. 2022
- Hillbrichtia pamiria Jasser et al. 2022^[4]
Marsacia Brown et al. 2010
Olisthonema
Panou and Gkelis 2022
- Olisthonema eestii Panou and Gkelis 2022^[5]
Pseudoscillatoria Rasoulouniriana et al. 2009

顫藻目

螺旋藻屬 Spirulina
科學分類
域：	細菌域 Bacteria
門：	藍菌門 Cyanobacteria
綱：	藍藻綱 Cyanophyceae
目：	顫藻目 Oscillatoriales Cavalier-Smith, 2002
科
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下屬分類

參照

參考文獻