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UniProt

蛋白质序列和功能信息数据库 来自维基百科,自由的百科全书

UniProt
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通用蛋白質資源庫(英語:Universal Protein resource直譯:「通用/聯合蛋白質資源」,混成詞UniProt),是通過結合瑞士蛋白質資料庫(Swiss-Prot)、歐洲分子生物學實驗室核苷酸序列資料庫與蛋白質轉譯庫(Translation of European Molecular Biology Laboratory nucleotide sequence database,縮寫TrEMBL)和蛋白質資訊資源-蛋白質序列資料庫(PIR-PSD)建立的蛋白質資料中央資料庫,一個全面的,高品質的,免費使用蛋白質序列與功能資訊資料,許多內容來自基因組計劃,它還包含了大量來自研究文獻的關於蛋白的生物學功能資訊。



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UniProt共同體

UniProt共同體由歐洲生物資訊研究所(EBI),瑞士生物資訊研究所(SIB)英語Swiss Institute of Bioinformatics,以及美國蛋白質資訊資源(PIR)英語Protein Information Resource組成。歐洲生物資訊研究所坐落於英國欣克斯頓英語Hinxton惠康信任基因組園區英語Wellcome Genome Campus,擁有大量的生物資訊學資料庫及服務資源。瑞士生物資訊研究所位於瑞士的日內瓦,維持專家蛋白質分析系統英語ExPASy,該系統是一個蛋白質組學工具和資料庫資源中心伺服器的運作。PIR由美國華盛頓特區喬治城大學醫學中心的國家生物醫學研究基金會 (National Biomedical Research Foundation,NBRF) 主辦,是最早的蛋白質序列資料庫,瑪格麗特·戴霍夫於1965年首次出版的《蛋白質序列和結構圖集》(Atlas of Protein Sequence and Structure)。2002年,EBI,SIB和PIR聯合成為UniProt共同體[2]

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UniProt資料庫的根源

每個共同體成員都積極參與蛋白質資料庫維護和注釋。 直到最近,歐洲生物資訊研究所(EBI)和瑞士生物資訊研究所(SIB)一起產生了瑞士蛋白質資料庫(Swiss-Prot)和TrEMBL資料庫,而蛋白質資訊資源(PIR)產生了蛋白質序列資料庫(Protein Information Resource-Protein Sequence Database,PIR-PSD)[3][4][5]。 這些資料庫與不同的蛋白質序列覆蓋和注釋優先級共存。

參考文獻

外部連結

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