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VMD
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VMD(英語：Visual molecular dynamics, 可視化分子動力學)是一套分子建模與可視化軟體[2]，主要用來分析分子動力學模擬的實驗數據。同時，軟體也包含處理長度與提及相關數據的模塊，能可視化與分析軌跡，添加任意圖形，並能導出成其他軟體能利用的格式例如POV-Ray，PRMan，VRML等。用戶能運行Tcl和Python腳本進行批量操作，也可通過Tcl/Tk與其他程序進行交互。VMD能在Unix，MacOS，Microsoft Windows等作業系統下運行[3]。對於非商業用途，VMD通過特定分發協議發布，用戶註冊後可免費使用和修改源碼[4]。
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參考資料
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