北京大學軟體與微電子學院正式成立於2002年，是中華人民共和國教育部和中華人民共和國國家發展和改革委員會以教高[2001]6號文正式批准北京大學等35所高等學校試辦的示範性軟體學院之一。2002年10月17日，北京大學軟體學院舉辦首屆開學典禮。