文献管理软件比较

以下列表比较文献管理软件，比较对象包括可能已不再受支持的旧版应用程序以及正在维护的软件。

常用

在“备注”一栏，有以下分类：

• 基于网页的应用程序，指安装在网页服务器上的应用程序（通常要求MySQL或其他数据库作後段，以及使用PHP、Perl、Python或者其他网页编程语言以供前段存取程式使用）
• 中央托管网站

软件	开发者	首次公开发行	最新稳定版本推出日期	最新稳定版本	价钱（美元）	是否为免費軟件	协议	备注
Bebop（英语：Bebop (software)）	ALaRI研究所（英语：Advanced Learning and Research Institute）	2007-11-08	2009-11-10	1.1	免费	是	BSD	基于网页的BibTeX前端（Apache、PHP、MySQL）
BibBase（英语：BibBase）	Christian Fritz	2005	2013-07	v3	免费	否	专有	中央托管网站，用于发布网页
BibDesk（英语：BibDesk）	BibDesk开发者	2002-04	2025-05-06	1.9.7[1]	免费	是	BSD	BibTeX前端+资源库；基于Cocoa；与Spotlight集成
BibSonomy（英语：BibSonomy）	卡塞尔大学	2006-01	2024-01-08	4.1.0	免费	是	AGPL, GPL, LGPL[2]	中央托管网站
Bookends（英语：Bookends）	桑尼软件	1988 (Mac) / 1983 (Apple II+)	2023-05-06	14.2[3]	US$59.99[a]	否	专有	通过iCloud同步桌面和iOS、集成网络搜索、PDF下载、Word插件、支持BibTex、将PDF注释存储为注释
Citavi（英语：Citavi）	Lumivero	2006-02-13	2023-08-15	6.17.0.0	US$89-1947[b]	否	专有	数据可保存在本地计算机上，也可保存在Citavi云或内网Microsoft SQL Server中，以便团队访问[4]；通过界面搜索数据库[5]
EndNote	科睿唯安	1988	2024-11-19	21.5[6]	US$299.95[a]	否	专有	网络版EndNote basicEndNote basic （页面存档备份，存于互联网档案馆）（前身为EndNote Web）免费
JabRef	JabRef开发者	2003-11-29	2023-10-21	5.11	免费	是	MIT许可证	Java编写的BibTeX及BibLaTeX（英语：Biber (LaTeX)）管理器
KBibTeX（英语：KBibTeX）	KBibTeX开发者	2005-08	2020-04-26	0.9.2	免费	是	GNU GPL	BibTeX前端，使用KDE软件编译器
Mendeley	愛思唯爾	2008-08	2020	1.19.8	免费/免费在线存储空间最高为2 GB/可提供额外存储空间	否	专有软件 (存在操作系统API客户端)	需要注册帐户、安装桌面和网络组件，提供Windows、Linux、macOS（非 macOS 11 Big Sur）客户端
Paperpile（英语：Paperpile）	Stefan Washietl, Gregorgy Jordan, Andreas Gruber	2013	持续在线更新		学术类US$2.99/月，其他US$9.99/月	否	专有	网络应用程序，与Google Docs集成，具有协作和共享功能，目前仅支持Google Chrome浏览器
Papers（英语：Papers (software)）	ReadCube	2011-10	2023-04-04	v.4.35.2224	学生US$3/月，学者US$5/月	否	专有	网络应用程序、桌面（MacOS、Windows）、手机（iOS和Android）。Microsoft Word和Google文档插件。浏览器扩展（Chrome、Firefox、Edge、Safari）
Pybliographer（英语：Pybliographer）	Pybliographer开发者	1998-10-30 (0.2)	2018-04-03	1.4.0	免费	是	GNU GPL	Python/GTK2
refbase（英语：refbase）	refbase开发者	2003-06-03	2014-02-28	0.9.6	免费	是	GNU GPL	基于网络的机构资料库（英语：Institutional repository）/自我存档（英语：Self-archiving）[7]
RefDB（英语：RefDB）	refdb开发者	2001-04-25	2022-02-13	1.0.3[8]	免费	是	GNU GPL	透明网络；XML/SGML文献目录
RefWorks（英语：RefWorks）	Ex Libris / ProQuest	2001	2022	4.6	机构订阅	否	专有	基于网络、浏览器访问、Word和Google文档
Wikindx（英语：Wikindx）	Mark Grimshaw, Stéphane Aulery	2003-02	2024-04-13	6.9.1	免费	是	ISC license	基于网络，适用于PHP和MySQL/MariaDB
Zotero	喬治梅森大學羅伊·羅森茨維格歷史與新媒體中心	2006	2025-03-16	7.0.15[9]	免费/在线存储免费，最大为300 MB/可提供额外存储空间	是	AGPL	多平台桌面版，拥有Firefox、Google Chrome和Safari的客户端。还可通过Zotero.org或用户电脑上的个人云数据库文件夹（Google Drive、Dropbox等）访问基于网络的参考资料库。

操作系统支持

对于网络应用程序，此段描述了服务器操作系统。对于专有的集中托管网站，则不适用。除非脚注中另有说明，否则任何客户端-服务器架构的操作系统都可以连接到Web服务。

软件	Windows	macOS	Linux	ChromeOS	BSD	Unix	iOS	Android	Windows App
Bebop	是	是	是	?	是	是	否	否	否
BibBase	不適用	不適用	不適用	不適用	不適用	不適用	?	?	?
BibDesk	否	是	否	否	否	否	否	否	否
BibSonomy	不適用	不適用	不適用	不適用	不適用	不適用	?	?	?
Bookends	否	是	否	?	否	否	是	?	?
Citavi	是	否	否	否	否	否	否	否	否
EndNote	是	是	否	否	否	否	是	否	否
JabRef	是	是	是	否	否	是	否	否	否
KBibTeX	實驗性質	實驗性質	是	?	是	是	否	否	否
Mendeley	是	是	是	否	否	否	否 （自2021年3月15日起逐步取消）[10]	否 （自2021年3月15日起逐步取消）[10]	否
Paperpile	是	是	是	是	否 （需要Chromium）	否 （需要Chromium）	是[11]	是[12]	否
Papers	是	是	否	是	否	否	是	是	是
Pybliographer	部份[c]	部份[c]	是	?	是	是	否	否	否
refbase	是	是	是	?	是	是	否	否	否
RefDB	是	是	是	?	是	是	否	否	否
RefWorks[13]	是	是	否	是	是	?	否	?	否
Wikindx	不適用	不適用	不適用	不適用	不適用	不適用	不適用	不適用	不適用
Zotero	是	是	是	仅Intel平台	否	是	是	第三方[14]	否

输出文件格式

本表列出了可从参考资料管理器导出的机器可读文件格式。这些格式通常用于与其他参考资料管理器或使用参考资料管理器的其他人共享数据。要从一个程序向另一个程序交换数据，第一个程序必须能够导出为第二个程序可以导入的格式。导入文件格式见下表。

软件	BibTeX	Endnote/Refer（英语：refer (software)）/BibIX	Medline	MODS XML（英语：Metadata Object Description Schema）	RIS（英语：RIS (file format)）	其它支持类型
Bebop	是	否	否	否	否	unAPI（英语：unAPI）
BibBase	是	否	否	否	否	无
BibDesk	是	否	是	是	是	Endnote XML，用户可自定义
BibSonomy	是	是	否	否	是	多种格式[15]
Bookends	是	是	是	否	是	多种用户自定义格式
Citavi	是	是	是	是	是	NVivo及其他多种软件
EndNote	是	是	是	否	是	多种格式[16]
JabRef	是	是	否	是	是	BibTeXML、DocBook、HTML、用于OOo的ODF、RTF、SQL 数据库、用户自定义
KBibTeX	是	是	否	依情況[d]	是	PDF、PostScript、HTML、XML、RTF
Mendeley	是	是	否	否	是	XML尾注
Paperpile	是	否	否	否	是	CSV、JSON
Papers	是	是	否	否	是	None
Pybliographer	是	是	是	否	否	Ovid（英语：Ovid Technologies）
refbase	是	是	否	是	是	COinS（英语：COinS）、用于OOo的ODF、通过SRU（英语：Search/Retrieve via URL）的SRW（英语：Search/Retrieve Web Service）XML、unAPI（英语：unAPI）、Word XML
RefDB	是	是	否	是	是	通过SRU（英语：Search/Retrieve via URL）网络服务的SRW（英语：Search/Retrieve Web Service）XML、DocBook、TEI
RefWorks	是	是	否	是	是	RIS、BibTeX、Tab delimited or XML metadata
Wikindx	是	是	否	否	是	COinS（英语：COinS）、HTML、PubMed、RTF
Zotero	是	是	从4.0版起[17]	是	是	COinS（英语：COinS）、Csv、多个RDF格式标准、TEI、维基百科引文模板、Endnote XML、CSL JSON、Refer/BiblX、RefWorks标签

输入文件格式

下表列出了无需连接特定数据库即可手动导入参考文献管理器的檔案格式。许多数据库公司使用的文件格式名称与其数据库名称相同（包括Copac（英语：Copac）、CSA（英语：Cambridge Scientific Abstracts）、ISI、MEDLINE、Ovid、PubMed和SciFinder）。有关从特定数据库（而非文件格式）检索引文的功能，请参阅本表下方的数据库连接表。

截至2021年1月 (2021-01)^[update]，任何参考资料管理系统都不支持CSL YAML^[18]。

软件	BibTeX	Copac（英语：Copac）	CSA（英语：Cambridge Scientific Abstracts）	EndNote/ Refer（英语：refer (software)）/BibIX	ISI	MEDLINE	MODS XML（英语：Metadata Object Description Schema）	Ovid（英语：Ovid Technologies）	PubMed	RIS（英语：RIS (file format)）	SciFinder	其它支持格式
Bebop	是	否	否	否	否	否	否	否	否	否	否	无
BibBase	是	否	否	否	否	否	否	否	否	否	否	无
BibDesk	是	是	否	是	是	是	是	否	是	是	是	MARC、JSTOR、Reference Miner
BibSonomy	是	否	否	是	否	否	否	否	否	否	否	Firefox瀏覽器书签
Bookends	是	是	是	是	是	是	否	是	是	是	是	多种用户自定义格式
Citavi	是	是	是	是	是	是	是	是	是	是	是	多种格式
EndNote	否	否	是	是	是	是	否	是	是	是	是	多种格式[19]
JabRef	是	是	是	是	是	是	是	是	是	是	是	BibTexML、Biomail、Inspec（英语：Inspec）、JSTOR、MSBib、带有XMP注释的PDF、REPEC（英语：Research Papers in Economics）、SilverPlatter（英语：SilverPlatter）、SixPack
KBibTeX	是	否	否	是	否	否	依情況[d]	否	是	是	否	无
Mendeley	是	否	否	是	否	否	否	否	否	是	否	浏览器书签
Paperpile	是	否	否	是	是	是	否	否	是	是	否	PDF、MARC
Papers	是	否	否	是	否	否	否	否	是	是	否	PDF
Pybliographer	是	否	否	是	是	是	否	是	否	否	否	无
refbase	是	是	是	是	是	是	是	否	是	是	是	RefWorks（英语：RefWorks）
RefDB	是	是[d]	否	是[d]	是[d]	是	是	否	是	是	是[d]	MARC, risx
RefWorks	是	是	是	是	是	是	是	是	是	是	是	多种格式[20]
Wikindx	是	否	否	是	否	否	否	是	是	否	否	BibReX LaTeX
Zotero	是	否[e]	否[e]	是	是	是	是	是	是	是	否	COinS（英语：COinS）、MARC、RDF、unAPI（英语：unAPI）、浏览器书签、Endnote XML、其它格式[21]

支持的引文格式

软件	APA	Chicago/Turabian（英语：A Manual for Writers of Research Papers, Theses, and Dissertations）	Harvard	MLA（英语：MLA_Handbook#MLA_Style_Manual）	其它格式	扩展模式
Bebop	否	否	否	否	否	否
BibBase	是	否	否	否	否	否
BibDesk	是	是	是	是	多种格式[22]	BibTeX样式文件（使用面向CSL的Pandoc§CiteProc（英语：Pandoc#CiteProc）[23]）或BibDesk导出模板[22]
BibSonomy	是	否	是	否	否	否
Bookends	是	是	是	是	多种格式	?
Citavi	是	是	是	是	多种格式[24]	Citavi格式（通过GUI），包括条件和可编程组件[24]；与LaTeX一起使用时，可使用BibTeX或BibLaTeX（英语：Biber (LaTeX)）（使用用于CSL的Pandoc§CiteProc（英语：Pandoc#CiteProc）[23]）
EndNote	是	是	是	是	多种格式[16]	EndNote格式（通过GUI）[16]
JabRef	是	是	是	是	多种格式	BibTeX样式文件或BibLaTeX（英语：Biber (LaTeX)）（使用用于CSL的Pandoc§CiteProc（英语：Pandoc#CiteProc）[23])
KBibTeX	是	是	是	是	多种格式	BibTeX样式文件（使用用于CSL的Pandoc§CiteProc（英语：Pandoc#CiteProc）[23])
Mendeley	是	是	是	是	多种格式[25]	CSL[25]
Paperpile	是	是	是	是	多种格式[25]	CSL[25]
Papers	是	是	是	是	多种格式[25]	CSL、BibTeX或BibLaTeX（英语：Biber (LaTeX)）与LaTeX一起使用[26]
Pybliographer	是	否	否	否	无	Pybliographer XML
refbase	是	是	是	是	各种极地和海洋期刊	PHP
RefDB	是	是	是	是	21种生物医学和法律期刊[27]	XML（citestylex.dtd）、交互式脚本
RefWorks	是	是	是	是	多种格式	RefWorks格式（通过GUI）[28]；CSL[25]
Wikindx	是	是	是	是	ABNT, BMJ, IEEE	Wikindx格式（通过GUI）
Zotero	是	是	是	是	多种格式[25]	CSL[25]；与LaTeX一起使用时，可使用BibTeX或BibLaTeX（英语：Biber (LaTeX)）[29]

参考列表文件格式

Endnote与LaTeX不兼容。

软件	HTML	LaTeX[f]	RTF	Plain text（英语：Plain text）	RSS	其它格式
Bebop	是	否	否	否	是	unAPI（英语：unAPI）
BibBase	是	否	否	否	是	否
BibDesk	是	是	是	是	是	Atom、DOC、PDF、XML
BibSonomy	是	否	是	是	是	CSV
Bookends	是	否	是	是	否	剪贴板
Citavi	是	是[g]	是	是	否	剪贴板, DOC, ODT, PDF, HTML
EndNote	是	否	是	是	否	剪贴板, XML
JabRef	是	是	是	是	否	剪贴板
KBibTeX	是	否	是	否	否	PDF、PostScript
Mendeley	是	是[h]	是	是	是	剪贴板、可嵌入的HTML部件、RSS
Paperpile	是	是	是	是	否	剪贴板
Papers	是	否	否	否	否	PDF
Pybliographer	是	?	否	是	否	否
refbase	是	是	是	是	是	Markdown、PDF、unAPI（英语：unAPI）
RefDB	是	?	是	是	否	DocBook, TEI
RefWorks	是	否	是	是	否	DOC, ODT
Wikindx	是	是	是	否	是	通过BibUtils插件实现多重功能
Zotero	是	可通过插件实现[31]	是	可通过插件实现[32]	是	剪贴板

与文字处理器的集成

一些参考文献管理软件支持在Word处理程序（英语：Word processor program）中自动嵌入和（重新）格式化参考文献。本表列出了Microsoft Word、Pages、Apache OpenOffice / LibreOffice Writer、LaTeX编辑器Kile和LyX以及Google Docs的此类支持。其他程序能够扫描RTF或其他文本格式，以查找随后格式化的插入占位符。大多数参考文献管理程序都支持将参考文献复制/粘贴或拖放到任何文本编辑器中，但在此不作介绍。

软件	Windows版Word	Mac版Word	在线版Word	Pages	Apache OpenOffice / LibreOffice	Kile/LyX	Google Docs	RTF scan[i]	其它
Bebop	否	否	否	否	否	否	否	否	无
BibBase	否	否	否	否	否	否	否	否	无
BibDesk	否	否	否	否	否	是	否	是	用户自定义脚本
BibSonomy	否	否	否	否	否	否	否	否	无
Bookends	是	是	否	是	是	否	否	是	Mellel（英语：Mellel）、Nisus（英语：Nisus Writer）
Citavi	是	是	否	否	仅适用于6.0之前的版本	是[33]	否	仅适用于6.0之前的版本	LaTeX编辑器Texmaker、TeXnicCenter（英语：TeXnicCenter）、TeXstudio、TeXworks（英语：TeXworks）、WinEdt、WinShell（英语：WinShell）
EndNote	是	是	否	是	否[34]	否	否	是	否
JabRef	是[35]	?	?	?	是[36]	是	否	?	Emacs、Texmaker、TeXstudio、Vim、WinEdt
KBibTeX	否	?	?	?	否	是	否	?	无
Mendeley	是	部份[j]	是[37]	否	是	否	否	?	NeoOffice
Paperpile	是	是	否	否	否	否	是	否	否
Papers	是	是	是[38]	是[39]	是	否	是	否	Manuscripts app、Scrivener（英语：Scrivener (software)）、Ulysses（英语：Ulysses (text editor)）
Pybliographer	否	?	?	?	是	是	否	?	无
refbase	否	?	?	?	是[40]	否	否	是	PIRA、MediaWiki、SPIP（英语：SPIP）
RefDB	否	?	?	?	否	否	否	否	无
RefWorks	是	是	否	否	否	否	是	是	无
Wikindx	否	否	否	否	否	否	否	否	集成式所见即所得文字处理器（HTML和RTF输出）
Zotero	是	是	否	否	是	(与LyZ）[41]	是	是	多种格式[42]

数据库连接性

本表列出了参考资料管理器可以导入的学术数据库和搜索引擎（英语：List of academic databases and search engines）。在某些情况下，可以直接在参考资料管理器中进行搜索和检索。在其他情况下，小书签或Firefox扩展程序将允许对网站进行抓取（英语：Data_scraping#Screen_scraping）。

软件	ArXiv	CiteSeer	IEEE Xplore	PubMed	Unpaywall（英语：OurResearch#Unpaywall）[k]	其它
Bebop	否	否	否	否	否	否
BibBase	否	否	否	否	否	DBLP、Zotero、BibSonomy（英语：BibSonomy）、Mendeley
BibDesk	是	是	否	是	否	ACM、JSTOR、DBLP、Google Scholar、Web of Science、任何Z39.50（英语：Z39.50）或Entrez等。
BibSonomy	是	是	是	是	否	多种格式[43]
Bookends	是	否	否	是	否	Web of Science、亚马逊、谷歌学术、Z39.50（英语：Z39.50）
Citavi	是	是	是	是	否	WorldCat/OCLC、Ovid Technologies（英语：Ovid Technologies）、EBSCO Industries（英语：EBSCO Industries）、ProQuest、Web of Science、Z39.50（英语：Z39.50）(4500+在线资源)、SRU（英语：Search/Retrieve via URL）。根据要求还将添加更多目录。浏览器插件（Firefox、Chrome、Internet Explorer）支持DOI查找、ISBN查找、PubMed ID查找、PMCID查找、arXiv ID查找、COinS（英语：COinS）以及从维基百科导入。.
EndNote	是	否	是	是	否	多种格式[44]任何Z39.50（英语：Z39.50）
JabRef	是	是	是	是	是[45]	ACM、Crossref、DBLP、DOAJ（英语：Directory of Open Access Journals）、DOI、GVK、Google Scholar、INSPIRE-HEP（英语：INSPIRE-HEP）、MEDLINE、MathSciNet、Astrophysics Data System、Springer Publishing（英语：Springer Publishing）和Zentralblatt MATH
KBibTeX	是	是	是	是	否	BibSonomy（英语：BibSonomy）、CiteBase、CSB（英语：Collection of Computer Science Bibliographies）、DBLP、Google Scholar、ScienceDirect、INSPIRE-HEP（英语：INSPIRE-HEP）、Z MATH、Z39.50（英语：Z39.50）
Mendeley	是	是	是	是	否	多种格式[46]
Paperpile	是	否	是	是	是	Google Scholar, INSPIRE-HEP（英语：INSPIRE-HEP）, ACM, Jstor, Web of Science
Papers	是	否	是	是	否	微软学术、谷歌学术
Pybliographer	否	否	否	是	否	无
refbase	是	否	否	是	否	DOI查询
RefDB	是	否	否	是	否	任何Z39.50（英语：Z39.50）
RefWorks	否	否	否	是	否	多种格式
Wikindx	否	否	否	是	否	谷歌学术索引元数据
Zotero	是	是	是	是	是[47]	多种格式[48]

密码“保护”和网络版本

有些参考管理器提供网络功能（N/A，不可用，表示产品没有网络功能，而“否”表示产品有网络功能，但缺乏已实施的功能）。轻型目录访问协议（LDAP）是一种开放的、供应商中立的行业标准应用层，用于通过网际协议（IP）网络访问和维护分布式目录服务。^[49]

软件	密码	LDAP	联网
			特定用户权限[l]	同时写入访问
Bebop	否	?	不適用	不適用
BibBase	不適用	?	不適用	不適用
BibDesk	是	?	否	否
BibSonomy	是	?	是	是
Bookends	?	?	?	?
Citavi	是[m]	?	是	是
EndNote	是	?	否[n]	否[n]
JabRef	否	?	否	部份
KBibTeX	否	?	不適用	不適用
Mendeley	是[o]	?	是	是
Paperpile	是[p]	?	是	是
Papers	是	?	是	是[50]
Pybliographer	?	?	?	?
refbase	是	?	是	是
RefDB	是	?	是	是
RefWorks	是	?	?	是
Wikindx	是	是	是	是
Zotero	是[q]	?	是	是

已停用软件

软件	开发者	首次公开发行	最新稳定版发布日期	最新稳定版本	费用（美元）	自由软件	许可	备注
Biblioscape（英语：Biblioscape）	CG Information	1997	2015-06-22	10.0.3.6	US$79-299[a]	否	专有	ODBC；专业版中的网络访问；可选的客户端/服务器；已停用？
Bibus（英语：Bibus）	Bibus开发者	2004-06-03	已停用	1.5.1	免费	是	GNU GPL
CiteULike（英语：CiteULike）	Oversity Limited	2004-11	于2019-03-30关闭[51]		免费	否	Proprietary[r]	中央托管网站
colwiz（英语：colwiz）	colwiz Ltd	2011	2016-05-09		免费 / 在线免费存储空间最高达3GB / 可提供额外存储空间	否	专有	现在与wizdom.ai合并
Qiqqa（英语：Qiqqa）	Qiqqa	2010-04	2020-10-04	v80	免费	是	GNU GPL	从2020年底开始开放源代码
Reference Manager（英语：Reference Manager）	汤森路透	1984	2010	12.0.3	不再出售，2015年12月31日停止销售	否	专有	网络版；内置网络发布工具；已停用
Referencer（英语：Referencer）	Referencer开发者	2008-03-15	已停用	1.2.2	免费	是	GNU GPL	BibTeX前端
RefME（英语：RefME）	RefME	2014	2017年关闭		免费	否	专有	网络、iOS和安卓；提供Chrome和Safari扩展；已停用
SciRef（英语：SciRef）	Scientific Programs	2012	2020-07-30	1.6.2	US$38.90 / 免费试用版	否	专有
Sente	Third Street Software, Inc.	2004	2017年关闭	6.7.9	US$60–80[a] / 免费提供给不超过 100 个参考资料的图书馆	否	专有	台式机和iPad，集中备份/同步；已停用
WizFolio	WizPatent	2008-06	2017年关闭	Avatara	US$25 / 免费基本版	否	专有	中央托管网站；已停用
Papyrus	Research Software Design	1991年之前	1997	7.0.17 for DOS/Windows and 8.0.12 for Mac OS	免费	是	未知	自2004年1月起免费