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UniProt

蛋白质序列和功能信息数据库 来自维基百科,自由的百科全书

UniProt
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通用蛋白质资源库(英語:Universal Protein resource直译:「通用/联合蛋白质资源」,混成词UniProt),是通过结合瑞士蛋白质数据库(Swiss-Prot)、欧洲分子生物学实验室核苷酸序列数据库与蛋白质翻译库(Translation of European Molecular Biology Laboratory nucleotide sequence database,缩写TrEMBL)和蛋白质信息资源-蛋白质序列数据库(PIR-PSD)创建的蛋白质数据中央数据库,一个全面的,高质量的,免费使用蛋白质序列与功能信息数据,许多内容来自基因组计划,它还包含了大量来自研究文献的关于蛋白的生物学功能信息。



事实速览 内容, 获取的数据类型 ...
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UniProt共同体

UniProt共同体由欧洲生物信息研究所(EBI),瑞士生物信息研究所(SIB)英语Swiss Institute of Bioinformatics,以及美国蛋白质信息资源(PIR)英语Protein Information Resource组成。欧洲生物信息研究所坐落于英国欣克斯顿英语Hinxton惠康信任基因组园区英语Wellcome Genome Campus,拥有大量的生物信息学数据库及服务资源。瑞士生物信息研究所位于瑞士的日内瓦,维持专家蛋白质分析系统英语ExPASy,该系统是一个蛋白质组学工具和数据库资源中心服务器的运作。PIR由美国华盛顿特区乔治城大学医学中心的国家生物医学研究基金会 (National Biomedical Research Foundation,NBRF) 主办,是最早的蛋白质序列数据库,玛格丽特·戴霍夫于1965年首次出版的《蛋白质序列和结构图集》(Atlas of Protein Sequence and Structure)。2002年,EBI,SIB和PIR联合成为UniProt共同体[2]

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UniProt数据库的根源

每个共同体成员都积极参与蛋白质数据库维护和注释。 直到最近,欧洲生物信息研究所(EBI)和瑞士生物信息研究所(SIB)一起产生了瑞士蛋白质数据库(Swiss-Prot)和TrEMBL数据库,而蛋白质信息资源(PIR)产生了蛋白质序列数据库(Protein Information Resource-Protein Sequence Database,PIR-PSD)[3][4][5]。 这些数据库与不同的蛋白质序列覆盖和注释优先级共存。

参考文献

外部链接

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