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蛋白質結構域
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蛋白質結構域(英語:protein domain)是蛋白質多肽鏈中具有特異結構和獨立功能的區域,能自穩定,獨立於其他區域摺疊,其構成蛋白質三級結構的基本單元。
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每個結構域形成一個緊湊的摺疊三維結構。許多蛋白質由幾個結構域組成,而一個結構域可能出現在各種不同的蛋白質中。有些球形蛋白的一條肽鏈,或以共價鍵相連的兩條或多條肽鏈在空間結構上可以區分為若干個球狀的子結構,其中的每一個球狀子結構就被稱為一個結構域。
同一個蛋白的各個結構域之間是以肽鏈相互連結的,而連結兩個蛋白質結構域的絕大多數都是單股肽鏈,只有在極個別的情況下會有少數的雙股肽鏈聯繫不同的結構域。在X射線晶體學繞射實驗繪製的電子密度圖中,可以清楚地看到有些球狀蛋白地的部存在一些裂隙,這些裂隙就是各個結構域之間的連結部分,蛋白質結構域之間的連結雖然是鬆散的,但他們仍然屬於同一條肽鏈,靠肽鏈連結這一點和蛋白質的各個亞基之間依靠非鍵相互作用維繫結構有着本質的區別。
蛋白質結構域在空間上具有臨近相關性:即在蛋白質一級結構上相互臨近的氨基酸殘基,在蛋白質結構域的三維空間結構上也相互臨近,在蛋白質一級結構上相互遠離的氨基酸殘基,在蛋白質結構域的空間結構上也相互遠離,甚至分別屬於不同的蛋白質結構域。
蛋白質結構域與蛋白質完成生理功能有着密切的關係,有時幾個結構域共同完成一項生理功能,有時一個結構域就可以獨立完成一項生理功能,但是一個結構不完整的蛋白質結構域是不可能產生生理功能的。因此蛋白質結構域是蛋白質生理功能的結構基礎,但必須指出的是,雖然蛋白質結構域與蛋白質的功能關係密切,但是蛋白質結構域和功能域的概念並不相同。