Protomera

Protomera – u strukturnoj biologiji – je strukturna jedinica oligomernog proteina. To je najmanja jedinica koja je sastavljena od najmanje dva različita proteinska lanca koji formiraju heterooligomer putem spajanja dvije ili više kopija ove jedinice.

Termin protomer je uveo Četverin^[1] za nomenklaturu u nedvosmislenosti Na/K-ATPaza. Na/K sadrži α- i β-podjedinicu (plus proteolipid, zvani γ-podjedinica). U to vrijeme nije bilo jasno koliko svaka id njih djeluje zajedno. Osim toga, kada se govorilo o dimerima, da li se odnose na αβ ili (αβ)₂, Četverin je predložio da je αβ protomer, a (αβ)₂ diprotomer.

Protomeri obično imaju obično cikličnu simetriju za formiranje zatvorenih simetrija grupe tačaka.

Primjeri

Hemoglobin je heterotetramer koji je sastavljen od četiri podjedinice (po dvije α i β). Međutim, strukturno i funkcijski, hemoglobin je opisan boljim u (αβ)₂, kada se kaže da je dimer dva αβ-protomera, tj. diprotomer.^[2]

Aspartat karbamoiltransferaza ima kompoziciju α₆β₆ podjedinica. Šest αβ-protomera se aranžiraju u simetriju D₃.

Virusne kapride često su načinjene od protomera.

Također pogledajte

• Kapsida
• Virus