RefSeq

Referentna sekvenca (RefSeq) baza podataka^[1] je otvorenog pristupa, označena i kurirana kolekcija javno dostupnih nukleotidnih sekvenci (DNK, RNK) i njihovih proteinskih proizvoda. RefSeq je prvi put predstavljen 2000.^[2][3] Ovu bazu podataka napravio je Nacionalni centar za biotehnološke informacije (NCBI) i, za razliku od GenBank, pruža samo jedan zapis za svaku prirodnu biološku molekulu (tj. DNK, RNK ili protein) za glavne organizme u rasponu od virusa i bakterija do eukariota.

Referentna sekvenca
Logo baze podataka
Skraćenica	RefSeq
Nasljednik	Novoosnovana
Datum osnivanja	Septebar 2017.
Vrsta	Kurirana baza podataka genoma bez redundantnih sekvenci
Status	Aktivna
Cilj	Baza podataka sekvenci DNK i RNK
Glavno sjedište	Nacionalni centar za biotechnološke informacije
Članstvo	Globalno
Jezik	Engleski
Glavni organ	Citiranje: Pruitt KD & al. (2005)[1]
Br. volontera	Neograničen
Veb-sajt	www.ncbi.nlm.nih.gov/RefSeq%20www.uniprot.org

Za svaki modelni organizam, RefSeq ima za cilj da obezbijedi zasebne i povezane zapise za genomsku DNK, transkripte gena i proteine koji proizlaze iz tih transkripata. RefSeq ograničen je na glavne organizme za koje je dostupno dovoljno podataka (više od 66.000 različitih „imenovanih“ organizama od septembra 2011.),^[4] dok GenBank uključuje sekvence za bilo koji podneseni organizam (približno 250.000 različitih imenovanih organizama).

Kategorije RefSeq

Kategorija	Opis
NC	Kompletne genomske molekule
NG	Nompletne genomske regije
NM	iRNK
NR	ncRNK
NP	Protein
XM	Predviđeni model iRNK
XR	Predviđeni model ncRNK
XP	Predviđeni model proteina (eukariotske sekvence)
WP	Predviđeni model [protein]]a (prokariotske sekvence)

Za više detalja i više kategorija, pogledajte Table 1 in Chapter 18 of the book The Reference Sequence (RefSeq) Database.

Također pogledajte

• GenBank
• Analiza sekvence
• Alat za profiliranje sekvenci
• Motiv sekvence
• UniProt
• Lista sekvenciranih eukariotskih genoma
• Lista sekvenciranih arhejskih genoma