Intensity fading MALDI-TOF mass spectrometry
Mètode interactòmic per a trobar contactes no covalents en una dissolució proteïca From Wikipedia, the free encyclopedia
Remove ads
El mètode Intensity fading MALDI-TOF mass spectrometry (IF MALDI-TOF MS o IF MALDI MS, entès en català com a Disminució de la intensitat per espectrometria de masses MALDI-TOF) és un sistema d'aproximació experimental d'interactòmica per a trobar interaccions no covalents en una dissolució entre proteïnes o complexos proteïcs,[1] que com el seu nom indica, es basa en les funcionalitats del sistema d'espectrometria de masses per ionització làser, el MALDI-TOF.[2][3]
Inicialment descrit i publicat el 1999,[3] posteriorment l'enfocament va ser qualificat falsament com a nou sota el terme reducció d'intensitat per a altres aplicacions.[2][4]
Remove ads
Funcionament i detecció del complex
La finalitat de l'IF MALDI-TOF MS és la detecció d'interaccions biomoleculars en mescles complexes emprant una quantitat mínima de mostra —requisit essencial de la investigació en l'àmbit de la biologia molecular i biologia cel·lular. Un dels seus grans avantatges és que permet la visualització d'una gran varietat de proteïnes fins i tot si la mostra en què es troben està bruta o sense purificar.
Aquesta metodologia es basa en l'ús de les intensitats de ions que proporciona un espectre de MALDI per a detectar ràpidament la formació de complexos no immobilitzats de caràcter biomolecular (proteïna-proteïna, proteïna-pèptid, proteïna-molècula orgànica o proteïna-àcid nucleic) en què una proteïna és un dels lligands o partners. És doncs, un mètode de selecció d'alt rendiment (high-troughput) en la proteòmica funcional.[4][5]
El complex es detecta a través de la disminució o esvaïment de les intensitats dels ions moleculars dels partners directament en comparació amb l'espectre de masses MALDI de la barreja (molècules problema i molècules de control) després de l'addició de la molècula diana —aquella a la qual es volen trobar candidats d'interacció. S'observarà l'aparició d'una nova banda o la desaparició i reducció d'una ja existent. El potencial de l'enfocament s'examina en diversos exemples d'interaccions, tant a nivell qualitatiu com semiquantitatiu.[6]
Remove ads
Vegeu també
Referències
Enllaços externs
Wikiwand - on
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Remove ads