SATB1

SATB1 (de l'anglès Special AT-rich sequence-binding protein-1, proteïna d'unió a seqüències especials riques en AT 1) és una proteïna que en humans està codificada pel gen SATB1.^[5]

SATB1
Estructures disponibles PDB Cerca ortòloga: PDBe RCSB Llista de codis id de PDB 1YSE, 2L1P, 2O49, 2O4A, 3NZL, 3TUO, 2MW8
Identificadors
Àlies	SATB1 (HUGO), SATB homeobox 1, DEFDA, KTZSL, DNA-binding protein SATB1/SATB2, SATB1/SATB2, IPR039673
Identif. externs	OMIM: 602075   MGI: 105084   HomoloGene: 2232   GeneCards: SATB1   OMA: SATB1 - orthologs
Localització del gen (humà) Cromosoma: 3 (humà)[1] Banda 3p24.3 Inici 18.345.377 bp[1] Fi 18.445.588 bp[1]
Localització del gen (ratolí) Cromosoma: 17 (ratolí)[2] Banda 17|17 C Inici 52.043.215 bp[2] Fi 52.140.318 bp[2]
Patró d'expressió d'ARN Bgee humà ratolí (ortòleg) Més explicacions orbitofrontal cortex  frontal pole  tim Brodmann area 46  lòbul parietal Gir postcentral paròtide Brodmann area 10  Escorça entorrinal Brodmann area 23  Més explicacions tim queixal barrel cortex  zigot secondary oocyte  Rostral migratory stream  substància negra glàndula lacrimal múscul vast lateral sang Més referències a dades d'expressió BioGPS Més referències a dades d'expressió
Ontologia genètica Funció molecular DNA binding  RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding  DNA-binding transcription factor activity  chromatin binding  unió proteica  DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific  double-stranded DNA binding  DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  sequence-specific DNA binding  Component cel·lular PML body  nuclear matrix  nucleoplasma  cromatina  nucli cel·lular  nuclear body  Procés biològic reflex  CD4-positive, alpha-beta T cell differentiation  CD8-positive, alpha-beta T cell differentiation  chromatin remodeling  activated T cell proliferation  regulació de la transcripció, modelat amb ADN  negative regulation of transcription by RNA polymerase II  chromatin organization  transcripció, plantilla d'ADN  epidermis development  histone methylation  procés viral  T cell activation  Fonts: Amigo / QuickGO
Ortòlegs Espècies Humà Ratolí Entrez 6304 20230 Ensembl ENSG00000182568 ENSMUSG00000023927 UniProt Q01826 Q60611 RefSeq (ARNm) NM_001131010 NM_001195470 NM_002971 NM_001322871 NM_001322872 NM_001322873 NM_001322874 NM_001322875 NM_001322876 NM_001163630 NM_001163631 NM_001163632 NM_009122 NM_001357636 NM_001357637 NM_001357638 NM_001357640 RefSeq (proteïna) NP_001124482 NP_001182399 NP_001309800 NP_001309801 NP_001309802 NP_001309803 NP_001309804 NP_001309805 NP_002962 NP_001157102 NP_001157103 NP_001157104 NP_033148 NP_001344565 NP_001344566 NP_001344567 NP_001344569 Localització (UCSC) Chr 3: 18.35 – 18.45 Mb Chr 17: 52.04 – 52.14 Mb Cerca a PubMed [3] [4]
Wikidata
Veure/Editar gen humà Veure/Editar gen del ratolí

Funció

SATB1 actua d'organitzador de la cromatina i com a factor de transcripció, integrant l'arquitectura d'alt ordre de la cromatina i la regulació gènica.^[6] Estudis recents han aclarit el paper de SATB1 en l'organització del loopscape de cromatina i la seva naturalesa dinàmica en resposta a estímuls fisiològics.^[7] A nivell genòmic, sembla que SATB1 jugaria un paper en l'organització de la cromatina que es troba a punt per a la transcripció. SATB1 organitza el locus del Complex Major d'Histocompatibilitat-1 (MHC-1) en diversos bucles de cromatina lligant MARs a la matriu nuclear a distàncies determinades. El silenciament de SATB1 imita els efectes de l'IFN-γ sobre l'arquitectura dels bucles de cromatina del locus de MHC-1 i l'expressió alterada de gens dins el locus. També s'ha mostrat que SATB1 pot induir el creixement de tumors i metàstasis en càncers de mama mitjançant una alteració en l'expressió de molts gens.

Interaccions

SATB1 presenta interaccions amb HDAC1,^[8] SMARCA5,^[8] MTA2,^[8] CHD4,^[8] CUTL1,^[9] POLR2J^[10] i BAZ1A.^[8]