Timeless (gen)

Timeless (tim) és un gen de múltiples espècies, però destaca pel seu paper a Drosophila per codificar TIM, una proteïna essencial que regula el ritme circadià. L'ARNm i la proteïna atemporals oscil·len rítmicament amb el temps com a part d'un bucle de retroalimentació negativa de transcripció i traducció que implica el gen del període (per) i la seva proteïna.

Timeless (gen)
Estructures disponibles PDB Cerca ortòloga: PDBe RCSB Llista de codis id de PDB 4XHT, 4XHU, 4XHW
Identificadors
Àlies	TIMELESS (HUGO), TIM, TIM1, hTIM, timeless circadian clock, timeless circadian regulator
Identif. externs	OMIM: 603887   MGI: 1321393   HomoloGene: 31206   GeneCards: TIMELESS   OMA: TIMELESS - orthologs
Malalties relacionades genèticament
verola [1]
Localització del gen (humà) Cromosoma: 12 (humà)[2] Banda 12q13.3 Inici 56.416.363 bp[2] Fi 56.449.426 bp[2]
Localització del gen (ratolí) Cromosoma: 10 (ratolí)[3] Banda 10 D3|10 76.49 cM Inici 128.067.934 bp[3] Fi 128.088.810 bp[3]
Patró d'expressió d'ARN Bgee humà ratolí (ortòleg) Més explicacions ventricular zone  embrió eminència ganglionar  Gònada mucosa of transverse colon  testicle right lobe of liver  apèndix vermiforme stromal cell of endometrium  illot de Langerhans Més explicacions lumbar spinal ganglion  otic vesicle  primary oocyte  otic placode  corpuscle renal zigot epiblast  sàcul tail of embryo  primitive streak  Més referències a dades d'expressió BioGPS
Ontologia genètica Funció molecular protein homodimerization activity  unió proteica  protein heterodimerization activity  DNA binding  Component cel·lular nucleoplasma  nucli cel·lular  nuclear chromosome  replication fork protection complex  site of double-strand break  cromosoma  Procés biològic cell cycle phase transition  regulació de la transcripció, modelat amb ADN  lung development  procés rítmic  negative regulation of transcription by RNA polymerase II  transcripció, plantilla d'ADN  divisió cel·lular  morphogenesis of an epithelium  desenvolupament d'organisme multicel·lular  regulation of cell population proliferation  regulation of circadian rhythm  ritme circadiari  cicle cel·lular  detection of abiotic stimulus  negative regulation of transcription, DNA-templated  branching morphogenesis of an epithelial tube  cellular response to DNA damage stimulus  cellular response to hydroxyurea  cellular response to cisplatin  cellular response to bleomycin  positive regulation of double-strand break repair  DNA replication checkpoint signaling  reparació de l'ADN  replication fork arrest  replication fork protection  positive regulation of double-strand break repair via homologous recombination  replicació de l'ADN  Fonts: Amigo / QuickGO
Ortòlegs Espècies Humà Ratolí Entrez 8914 21853 Ensembl ENSG00000111602 ENSMUSG00000039994 UniProt Q9UNS1 Q9R1X4 RefSeq (ARNm) NM_003920 NM_001330295 NM_001136082 NM_001164080 NM_001164081 NM_011589 RefSeq (proteïna) NP_001317224 NP_003911 NP_001129554 NP_001157552 NP_001157553 NP_035719 Localització (UCSC) Chr 12: 56.42 – 56.45 Mb Chr 10: 128.07 – 128.09 Mb Cerca a PubMed [4] [5]
Wikidata
Veure/Editar gen humà Veure/Editar gen del ratolí

Estructura de cristall de la forma nativa del domini Timeless_PAB

Descobriment

Una visió general dels gens i proteïnes més importants del rellotge biològic de Drosophila melanogaster. La molècula d'ADN està modificada a partir d'ADN Overview per Michael Ströck, publicat sota GFDL i publicat a Commons. PER=Període, TIM=Timeless, CLK=Clock, CYC=Cycle, VRI=Vrille, PDP1=PAR Domain Protein 1ε, DBT=Doubletime, CRY=Cryptochrome

El 1994, atemporal va ser descobert a través d'un cribratge genètic avançat realitzat per Jeffery L. Price mentre treballava al laboratori de Michael W. Young.^[6] Aquest gen es va trobar quan van notar un mutant tim⁰¹ arrítmic mitjançant una pantalla d'element P.^[7][8] La mutació tim⁰¹ va provocar un comportament arrítmic, definit per la manca d'habilitat per establir ritmes circadians adequats.^[6] El 1995, el gen atemporal va ser clonat per Amita Sehgal i socis del laboratori de Michael W. Young.^[9] A diferència del gen atemporal de Drosophila, s'han descobert homòlegs en altres espècies que no són essencials per al ritme circadià.^[10] El descobriment de l'atemporal va seguir el descobriment dels mutants del període el 1971 mitjançant un cribratge genètic avançat, la clonació de per el 1984 i un experiment que va determinar que per és circadià el 1990. Això va passar durant un període de ràpida expansió en el camp de la cronobiologia als anys noranta.

Estructura

La longitud de la regió codificant del gen atemporal de la Drosophila és de 4029 parells de bases, a partir dels quals es transcriu una proteïna de 1398 aminoàcids.^[11] El gen comença en un lloc de consens aigües amunt d'un codó de metionina. Conté 11 exons i 10 introns. En diverses espècies de Drosophila, la proteïna atemporal TIM conté dominis funcionals i seqüència d'aminoàcids més altament conservats que la seva contrapart, PER (proteïna codificada per per ). La CLD va ser la menys conservada d'aquestes regions entre D. virilis i D. melanogaster.^[11] Aquestes parts conservades inclouen: el domini d'interacció PER, el senyal de localització nuclear (NLS), el domini de localització citoplasmàtica (CLD), l'extrem N-terminal (no funcional) i l'extrem C-terminal.^[11] També se sap que TIM té una regió bàsica, que interacciona amb el domini PAS de la proteïna PER, i una regió àcida central. També hi ha una regió de funció desconeguda prop de l'extrem N de la proteïna TIM que conté una seqüència de 32 aminoàcids que, quan s'elimina, provoca un comportament arrítmic a la mosca. En diverses espècies de Drosophila, com ara D. virilis i D. melanogaster, la metionina inicial per a la traducció del gen atemporal a TIM es troba en diferents llocs, amb el lloc d'inici de D. virilis aigües avall del lloc d'inici a D. melanogaster.^[11]