Parvarchaeota

Parvarchaeota je kmen patřící do domény Archea.

Parvarchaeota
Vědecká klasifikace
Doména	Archea
Kmen	Parvarchaeota
Některá data mohou pocházet z datové položky.

Taxonomie

Dle taxonomie Národního centra pro biotechnologické informace (NCBI) je tento kmen součástí skupiny DPANN společně s kmeny Diapherotrites, Woesearchaeota, Pacearchaeota, Aenigmarchaeota, Nanohaloarchaeota a Nanoarchaeota. Zástupce kmene Parvarchaeota označujeme „Candidatus Parvarchaeales“. Status „candidatus“ je prozatímní označení přiřazované dobře charakterizovaným mikroorganismům, které ale nejsme schopni získat v čisté kultuře v laboratorních podmínkách.^[1]

Charakteristika

Zástupci kmene Parvarchaeota mají relativně malý genom, jehož velikost je odhadována na 0,53–0,76 Mb.^[2] Jejich metabolické schopnosti jsou omezené, postrádají například metabolické dráhy pro syntézu nukleotidů a aminokyselin. Bylo prokázáno, že studovaní zástupci žijí v blízkosti jedinců z řádu Thermoplasmatales, kteří mohou potenciálně poskytovat potřebné aminokyseliny.^[3] Disponují metabolickými drahami, jako je glykolýza, citrátový cyklus, elektronový transportní řetězec a několik cest pro degradaci polysacharidů, které se obvykle nenacházejí u jiných zástupců skupiny DPANN.^[4]

Výskyt

Parvarchaeota se vyskytují v extrémních podmínkách s nízkým pH a vysokým obsahem těžkých kovů,^[2] např. v horkých pramenech nebo kyselé důlní drenáži.^[4]

První zástupci kmene Parvarchaeota, společně se zástupci kmene Micrarchaeota, byli objeveni v acidofilních biofilmech v bývalém dole Richmond (Iron Mountain, Kalifornie, ve Spojených státech amerických). Kvůli tomuto nalezišti se Parvarchaeota řadí do skupiny mikroorganismů označovanou zkratkou ARMAN (Archaeal Richmond Mine Acidophilic Nanoorganisms).^[2] Parvarchaeota obývají zřejmě užší škálu biotopů než Micrarchaeota, která se vyskytují kromě horkých pramenů a kyselého prostředí také na místech se zvýšenou radioaktivitou nebo v běžnějších podmínkách, jako jsou například běžné odpadní vody.^[4]