Cap-independent Translation Element

Ein Cap-independent Translation Element (CITE oder 3'CITE, zu deutsch Cap-Struktur-unabhängiges Translationselement) ist eine bestimmte RNA-Sequenz in der 3'UTR von einigen pflanzenpathogenen RNA-Viren.

Eigenschaften

In Eukaryoten dient die Cap-Struktur am 5'-Ende der mRNA der Einleitung der Proteinbiosynthese. In manchen RNA-Viren kommen alternative Mechanismen vor, z. B. IRES oder CITE.^[1] Durch die alternativen Mechanismen werden entweder die 60S-Untereinheit des Ribosoms oder Translations-Initiationsfaktoren (z. B. eIF4E)^[2] gebunden.^[3] Das CITE in manchen Viren führt zu einer Annäherung des 5'- und des 3'-UTRs.^[4]

In der RNA2 des red clover necrotic mosaic virus (RCNMV) ist das CITE zudem essentiell für die Replikation der viralen RNA negativer Polarität.^[5]

CITE können nach ihrem Aufbau in verschiedene Typen eingeteilt werden:^[1][3]

Struktur	Beispiel
TED (translation enhancer domain)	Satellite tobacco necrosis virus (STNV)[6]
BTE (BYDV-like translation element)	Barley yellow dwarf virus (BYDV)[7]
PTE (PMV-like translation element)	Hirse-Mosaik-Virus (en. Panicum mosaic virus, PMV)
TSS (T-shaped structure, ‚T-förmige Struktur‘)	Turnip crinkle virus (TCV)[8]
Y-förmig	Tomato bushy stunt virus (TBSV)
I-förmig	Maize necrotic streak virus (MNeSV)

Literatur

• BL Nicholson, O. Zaslaver, L.K. Mayberry, K.S. Browning, K.A. White: Tombusvirus Y-Shaped Translational Enhancer Forms a Complex with eIF4F and Can Be Functionally Replaced by Heterologous Translational Enhancers. In: Journal of Virology. 87. Jahrgang, Nr. 3, Februar 2013, S. 1872–83, doi:10.1128/JVI.02711-12, PMID 23192876.