SYPRO Red

SYPRO Red ist ein Fluoreszenzfarbstoff vom Merocyanin-Typ,^[1] der zur Färbung von Proteinen im Zuge einer Proteincharakterisierung verwendet wird,^[2] meistens in einer SDS-PAGE.^[3][4]

Struktur von SYPRO Red, soweit bekannt.^[1] m = 5–6, n = 2–4.^[2]

Eigenschaften

SYPRO Red bindet wie auch sein Analogon SYPRO Orange selektiv an Proteine über 6,5 Kilodalton (auch Glykoproteine) in SDS-Micellen,^[1] nicht jedoch an DNA oder Lipopolysaccharide.^[5][6] Die Mutagenität, Reproduktionstoxizität und Karzinogenität von SYPRO Red ist unbekannt.^[5] Die Absorptionsmaxima liegen bei λ = 300 nm und 550 nm, die Emission ist bei λ = 630 nm maximal.^[5] Die Sensitivität bei SDS-PA-Gelen liegt mit SYPRO Red bei etwa 4–8 ng Protein,^[5][7] also etwas schlechter als bei der Silberfärbung. Aufgrund der Fluoreszenz besitzt die SYPRO Red-Färbung bei einer Mengenabschätzung im Vergleich zur Silberfärbung oder Coomassie einen größeren linearen dynamischen Bereich, d. h. eine bessere Korrelation zwischen der Proteinmenge und der Signalintensität.^[5] SYPRO Red eignet sich nicht zur Färbung von Proteinen auf Western Blots, 2D-Gelen oder IEF-Gelen.^[5] Im Gegensatz zur Silber- und Coomassie-Färbung werden zur Fixierung vor einer Färbung zwar Essigsäure verwendet, jedoch keine Alkohole wie Methanol oder Ethanol, da SYPRO Red zur Färbung auf die Anwesenheit von SDS angewiesen ist.^[7]