Pseudomonadati

Pseudomonadati, anteriormente Gracilicutes o Hydrobacteria es un reino de bacterias gramnegativas que presenta gran respaldo en los estudios filogenéticos y que está conformado por los grupos Pseudomonadota, Spirochaetota, PVC, FCB y otros filos.^[1]

Pseudomonadati
Células de Vibrio cholerae
Taxonomía
Dominio:	Bacteria
Reino:	Pseudomonadati Göker et al 2024
Superfilos y filos
Grupo FCB o Sphingobacteria Bacteroidota, Fibrobacterota, Calditrichota, Gemmatimonadota, Cloacimonadota, Fidelibacterota, Latescibacteriota, Fermentibacterota, Zixiibacteriota, Hydrogenedentota, Hydrothermota, Delphinibacteriota, Delongiibacteriota, Raymondiibacteriota, Eiseniibacteriota, Edwardsiibacteriota, Krumholzibacteriota Grupo PVC o Planctonbacteria Planctomycetota, Verrucomicrobiota, Chlamydiota, Omnitrophota, Auribacterota, Sumerlaeota, Ratteibacteriota, Coatesiibacteriota, Poribacteriota Otros Acidobacteriota, Pseudomonadota, Spirochaetota, Aquificota, Thermodesulfobacteriota, Nitrospirota, Nitrospinota, Chrysiogenota, Deferribacterota, Moduliflexota, Elusimicrobiota, Methylomirabilota, Tectimicrobiota, Babelota, Binatota, Schekmanikbacteriota, Desantisiibacteriota, Goldiibacteriota, Firestonebacteria, Mcinerneyibacteriota, Muirbacteriota, Rifleibacteriota, Lindowiibacteriota, Walliibacteriota,
Sinonimia
Gracilicutes Gibbons et Murray, 1978 Hydrobacteria Battistuzzi et al. 2008
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Fue inicialmente creado como taxón en 1978 por Gibbons y Murray,^[2] editores del Manual de Bergey, para agrupar a las bacterias gram negativas poseedoras de una delgada pared celular, nombrado Gracilicutes proviene de cutes = piel y gracilis = delgado, en alusión a esta delgada pared de mureína. El término Hydrobacteria alude a que este grupo habría evolucionado en el océano, en contraposición a otro supergrupo, Terrabacteria o Bacillati, que evolucionó en hábitat terrestres. En 2024 el grupo fue nombrado Pseudomonadati otorgándole rango de reino.

Características

• La pared celular es típicamente delgada y en ciertos casos se ha perdido.
• Son bacterias gramnegativas debido a que la pared de peptidoglicano no es externa.
• Son didérmicas, es decir, presentan dos membranas celulares , la interna o citoplasmática y la externa que envuelve a la pared bacteriana.
• A diferencia de otras bacterias didérmicas, la membrana externa presenta moléculas grandes y complejas de lipopolisacáridos, cuya porción lipídica actúa como una endotoxina.
• Predominantemente son acuáticas o de medios húmedos.
• Son flagelados, el flagelo bacteriano se inserta en la pared y membranas celulares.
• Son mesófilos o psicrófilos (no son termófilos, salvo pocas excepciones).
• El metabolismo es muy versátil y variado.
• Presencia del inserto proteico Hsp60.

En realidad, todas estas características se presentan también en el filo Cyanobacteriota, por lo que podría haber alguna relación evolutiva, y de acuerdo con R. Gupta formarían un clado, aunque esto no ha sido respaldado dado que las cianobacterias forman parte de Bacillati.^[3]

Fusobacteriota estaría en la base del supergrupo Pseudomonadati de acuerdo con la filogenia concatenada de los ARN ribosómicos 16S y 23S,^[4] así como lo obtenido con análisis genómicos recientes (2019).^[5]

Filogenia

Dentro de la filogenia bacteriana, Pseudomonadati está bien respaldado como un superclado por numerosos estudios basados en el ARNr 16S, 23S, proteínas, enzimas, secuencias de genes, citología y microbiología evolutiva.

Una filogenia algo consensuada en el GTDB database y el Annotree es la siguiente:^[6][7]

Bacteria

Bacillati     Thermotogati         Fusobacterati   Pseudomonadati        Mcinerneyibacteriota       Muirbacteriota       Walliibacteriota     Rifleibacteriota             Lindowiibacteriota     Spirochaetota              FCB    Hydrogenedentota           Latescibacteriota       Edwardsiibacteriota     Zixiibacteriota             Krumholzibacteriota     Eiseniibacteriota         Fermentibacterota     Gemmatimonadota             Hydrothermota         Cloacimonadota       Raymondbacteria     Fibrobacterota             Delongiibacteriota     Delphinibacteriota         Calditrichota       Fidelibacterota   Bacteroidota     Kapabacteria       Kryptonia     Ignavibacteria           Chlorobia       Rhodothermia     Bacteroidia                               Desantisiibacteriota         Goldiibacteriota     Firestoneibacteriota       Elusimicrobiota       PVC       Sumerlaeota     Poribacteriota         Coatesiibacteriota     Planctomycetota             Ratteibacteriota     Omnitrophota         Auribacterota       Chlamydiota   Verrucomicrobiota   Kiritimatiellae       Lentisphaerae     Verrucomicrobiae                           Binatota       Thermodesulfobacteriota       Nitrospirota         Moduliflexota     Methylomirabilota         Schekmaniibacteriota       Nitrospinota     Tectimicrobiota                     Pseudomonadota       Acidobacteriota       Babelota       Aquificota       Chrysiogenota     Deferribacterota

Otros análisis filogenéticos especialmente de Cavalier-Smith (2020) han sugerido que Planctobacteria (grupo PVC) es el grupo hermano de Neomura, el clado que incluye a las arqueas y eucariotas, lo que haría que Pseudomonadati sea un taxón parafilético de Neomura. Sin embargo está filogenia no es respaldada por la mayoría de los estudios.^[8][9]

Cytota

Chloroflexota     Eoglycobacteria   Cyanobacteriota y relacionados       Minisyncoccota     Armatimonadota y relacionados           Bacillota       Actinomycetota       Fusobacteriota y relacionados       Thermotogati (Thermobacteria)       Pseudomonadota y relacionados       Spirochaetota y relacionados       Sphingobacteria (FCB)       Planctobacteria (PVC)   Neomura   Methanobacteriota (incluyendo a Nanobdellati)       Thermoproteota (TACK)   Promethearchaeota   Promethearchaeia y relacionados       Heimdallarchaeia    + α─proteobacteria  Eukaryota