ADN B

L'ADN B est la forme a priori la plus courante de la double hélice d'ADN constituant le matériel génétique des cellules vivantes^[1]. Elle fut décrite en 1953 par Crick, Watson et Wilkins d'après les travaux cristallographiques de Franklin. L'ADN B se caractérise par un diamètre d'environ 2 nm et un allongement moyen de 0,34 nm par paire de bases ajoutée, chaque tour d'hélice comprenant entre 10,4 et 10,5 paires de bases en solution. Elle possède deux sillons inégaux typique-ment de 2,2 nm pour le grand sillon et de 1,2 nm pour le petit sillon^[2]. Il en résulte que les bases nucléiques sont plus accessibles de l'extérieur au niveau du grand sillon, et c'est typiquement à ce niveau que se lient sélectivement des protéines telles que les facteurs de transcription en fonction de la séquence de l'ADN^[3].

De gauche à droite : ADN A, ADN B et ADN Z.

Paramètres structurels indicatifs des trois principales formes d'ADN bicaténaire^[4],[5],[6]

Paramètre	ADN A	ADN B	ADN Z
Sens de l'hélice	droite	droite	gauche
Motif répété	1 bp	1 bp	2 bp
Angle de rotation par paire de bases	32,7°	34,3°	60°/2
Nombre de paires de bases par tour d'hélice	11	10,5	12
Pas de l'hélice par tour	2,82 nm	3,32 nm	4,56 nm
Allongement de l'axe par paire de bases	0,24 nm	0,32 nm	0,38 nm
Diamètre	2,3 nm	2,0 nm	1,8 nm
Inclinaison des paires de bases sur l'axe de l'hélice	+19°	−1,2°	−9°
Torsion moyenne (propeller twist)	+18°	+16°	0°
Orientation des substituants des bases sur les résidus osidiques	anti	anti	Pyrimidine : anti, Purine : syn
Plissement / torsion endocyclique du furanose (Sugar pucker)	C3’-endo	C2’-endo	Cytosine : C2’-endo, Guanine : C3’-endo

Grand et petit sillons de l'ADN B.