Les quatre prototypes RBDe 4/4 2100 à 2103 ont initialement porté chacun une livrée spécifique. À la suite d'une période d'essais, la livrée de la 2103 a été choisie, avec adjonction de portes jaunes, plus visibles que les portes rouges. Les quatre motrices ont alors été normalisées. À noter qu'elles n'étaient pas équipées de sablières; elles en reçurent lors de la normalisation.
Première série
Les prototypes montrant satisfaction, les CFF passèrent commande pour 80 automotrices et autant de voitures-pilote. D'abord immatriculées RBDe 4/4 2104 à 2183, elles reçurent plus tard la numérotation UIC RBDe 560.
Seconde série
Une seconde série de 42 paires fut commandées. Celles-ci se différenciaient de la série précédente par le design de la bande bleue latérale, et par la présence d'un appareil de climatisation au-dessus des cabines de conduite. Elles furent directement désignées par l'appellation UIC RBDe 560.
N'étant dotée que d'une seule cabine de conduite, chaque automotrice est livrée avec une voiture-pilote de seconde classe (type Bt), permettant, le cas échéant, d'incorporer des voitures intermédiaires.
Bt 50 85 29-34 900 à 903 (4): prototypes pour RBDe 4/4 2100 à 2103 (RBDe 560 000 à 003);
Bt 50 85 29-34 904 à 983 (80): 1re série pour RBDe 4/4 2104 à 2183 (RBDe 560 004 à 083);
Bt 50 85 29-35 900 à 941 (42): 2esérie pour RBDe 560 100 à 141.
Lors de la transformation en NPZ Domino, les Bt sont reclassées en ABt par adjonction de la première classe (transformation de la moitié de la voiture, côté cabine de conduite). Pour les besoins du Glarner Sprinter, deux Bt ont été transformées en At, ne comprenant que de la 1re classe.
Le projet Domino prévoit la restructuration des RBDe 560 et voitures pilote existants avec l'adjonction de voitures intermédiaires neuves à plancher surbaissé. Ces véhicules reconstruits sont ou seront mis en service dans les cantons suivants:
Genève: 8 rames avec un véhicule intermédiaire circulant selon l'horaire en simple traction ou double traction (Coppet-Lancy Pont Rouge);
Vaud: 13 rames peu à peu en service dès août 2010 (S11 et S21) et dès 2013 sur la ligne S31 Train des Vignes;
Valais: 16 rames aujourd'hui de St-Gingolph à Brigue;
Jura: 7 rames mi-2011 (Les lignes les plus peuplées);
Des 128 motrices existantes, les 4 prototypes (000 à 003) ne seront pas transformées (elles ont été vendues à d'autres entreprises), tout comme les 6 automotrices transformées en bicourant 15/25 kV (RBDe 562) qui resteront dans leur état actuel. Les Domino formeront donc 118 compositions. La motrice se nomme la RBDe 560 la voiture pilote l'ABt NPZ et la voiture intermédiaire B INOVA.
Blasons
Pratiquement toutes les RBDe arboraient des armoiries de communes de Suisse. Ces blasons disparurent lors de leurs transformations en Domino.