APAF1

Apaf-1 (Apoptotic peptidase activating factor 1) est une protéine qui rentre dans la composition de l'apoptosome et joue un rôle dans la voie de signalisation intrinsèque déclenchant l'apoptose.

APAF1
Structures disponibles PDB Recherche d'orthologue : PDBe RCSB Identifiants PDB 1C15, 1CWW, 1CY5, 1Z6T, 2P1H, 2YGS, 3J2T, 3YGS, 4RHW, 3JBT
Identifiants
Alias	APAF1
IDs externes	OMIM: 602233 MGI: 1306796 HomoloGene: 7626 GeneCards: APAF1
Position du gène (humain) Chr. Chromosome 12 humain[1] Locus 12q23.1 Début 98,645,290 bp[1] Fin 98,735,433 bp[1]
Position du gène (souris) Chr. Chromosome 10 (souris)[2] Locus 10 C2|10 45.47 cM Début 90,989,311 bp[2] Fin 91,082,770 bp[2]
Expression génique Bgee Humain Souris (orthologue) Fortement exprimé dans monocyte ventricular zone sang cellule de la moelle osseuse éminence ganglionnaire epithelium of colon granulocyte tendon calcanéen os spongieux testicule Fortement exprimé dans granulocyte derme migratory enteric neural crest cell uretère Jéjunum canal déférent Vesicula otica stroma of bone marrow gastrula iléon Plus de données d'expression de référence BioGPS Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology Fonction moléculaire heat shock protein binding ADP binding liaison protéique identical protein binding liaison ATP liaison nucléotide cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process Composant cellulaire cytoplasme cytosol exosome noyau apoptosome région extracellulaire secretory granule lumen ficolin-1-rich granule lumen complexe macromoléculaire Processus biologique cellular response to transforming growth factor beta stimulus neuron apoptotic process regulation of apoptotic process différenciation cellulaire response to hypoxia response to nutrient response to G1 DNA damage checkpoint signaling vieillissement positive regulation of apoptotic signaling pathway glial cell apoptotic process neurodéveloppement développent d'un organisme multicellulaire cardiac muscle cell apoptotic process intrinsic apoptotic signaling pathway intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress neural tube closure développement cérébral positive regulation of apoptotic process apoptotic signaling pathway forebrain development regulation of apoptotic DNA fragmentation protein homooligomerization activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process by cytochrome c apoptose neutrophil degranulation negative regulation of G0 to G1 transition kidney development Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues Espèces Homme Souris Entrez 317 11783 Ensembl ENSG00000120868 ENSMUSG00000019979 UniProt O14727 O88879 RefSeq (mRNA) NM_001160 NM_013229 NM_181861 NM_181868 NM_181869 NM_001042558 NM_001282947 NM_009684 RefSeq (protéine) NP_001151 NP_037361 NP_863651 NP_863658 NP_863659 NP_001036023 NP_001269876 NP_033814 Localisation (UCSC) Chr 12: 98.65 – 98.74 Mb Chr 10: 90.99 – 91.08 Mb Publication PubMed [3] [4]
Wikidata
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Apaf-1 est présent dans le cytosol à l'état normal de la cellule, mais il est sous une conformation repliée inactive. La liaison du cytochrome c (CYC) à l'Apaf-1 entraîne une modification conformationnelle et l'exposition du domaine CARD, qui permet à plusieurs protéines Apaf-1 activées de s'assembler : c'est l'apoptosome.

Structure

Apaf-1 possède 3 domaines notables^[5].

• un domaine CARD (en) N-terminal permettant le recrutement de caspases (en particulier la caspase 9)
• un domaine NOD permettant la polymérisation (fixation avec d'autres apaf-1)
• un domaine WRD C-terminal permettant la fixation du cytochrome c.