Phytoplasme

Les phytoplasmes sont des bactéries, de la famille des Acholeplasmataceae (en), infectant les plantes. ce sont des bactéries pléiomorphes du fait de leur absence de paroi. Ce sont des pathogènes des plantes que ce bactéries infectent via un vecteur comme la cicadelle.

Candidatus Phytoplasma

Phyllodie sur une plante du genre Solidago

Classification LPSN

Domaine	Bacteria
Règne	Bacillati
Phylum	Mycoplasmatota
Classe	Mollicutes
Ordre	Acholeplasmatales
Famille	Acholeplasmataceae

Genre

Phytoplasma
Firrao (d) et al. 2004

Jaunissement mortel du palmier.

Description

Dépourvus de paroi cellulaire rigide, les phytoplasmes sont délimités par une double membrane et n'ont pas de forme spécifique., ce sont des (procaryotes pléiomorphes). Ils appartiennent à la classe des Mollicutes. À leur découverte ils ont été nommés MLO (abréviation de Mycoplasma Like Organism) en raison de leur ressemblance (en microscopie électronique) avec les mycoplasmes^[1].

Ils sont à l’origine de nombreuses maladies bactériennes des plantes telles que la phyllodie par exemple. Ils sont transmis par des insectes vecteurs, le plus souvent des cicadelles. La croissance intracellulaire se fait dans les glandes salivaires, le tractus intestinal, l'hémolymphe. Le temps de latence avant la transmission varie de 10 à 45 jours suivant la température. Parfois on note une une longévité des vecteurs un peu réduite^[1].

L'acquisition des phytoplasmes est rendue plus efficace par les larves. Les symptômes (phytoplasmes) peuvent être la jaunisse foliaire, le nanisme, la phyllodie, la virescence ou l'apparition de proliférations appelées « balai de sorcière ». Ils se multiplient exclusivement dans les tubes criblés du phloème de leurs hôtes^[2].

Exemple de la prolifération du pommier

La prolifération du pommier est une maladie anciennement connue mais discrète ces dernières années, qui connaît actuellement une certaine recrudescence. Elle est due à un phytoplasme transmis par au moins une espèce de psylle. Sa recrudescence est probablement liée à l'allègement des traitements insecticides polyvalents dans le cadre de la lutte intégrée, dans les vergers mais aussi leur environnement. Une fois la maladie identifiée (examen des symptômes et vérification au laboratoire), le seul moyen de lutte est l'arrachage des arbres.

Taxonomie

Les phytoplasmes appartiennent à l'ordre monophylétique des Acholeplasmatales (en)^[3]. En 1992, étant donné que ces bactéries infectent des plantes, le sous-comité de taxonomie des Mollicutes du Comité international de systématique des procaryotes a proposé d'employer le nom de Phytoplasma au lieu du terme pseudo-mycoplasme ou MLO (mycoplasma-like organism) « en référence aux mollicutes phytopathogènes »^[4],[1]. Le nom générique Phytoplasma fut adopté en 2004. Il reste encore actuellement, en juin 2025^[5], sous le statut de Candidatus^[6], qui est employé pour désigner les bactéries qui ne peuvent être cultivées. Sa taxonomie est compliquée car il ne peut pas être cultivé, donc les méthodes normalement utilisées pour la classification des procaryotes ne sont pas possibles^[3]. Cela complique également le séquençage de ces bactéries car elles sont intracellulaires. Il faut donc déterminer des amorces de séquençage très spécifiques. Des groupes taxonomiques ont pu être établis grâce à la méthode PAUP et le séquençage de l'ARNr 16S et des régions intergéniques 16S-23S^[7].

La classification des phytoplasmes en groupes taxonomiques a été fondée sur des différences de taille des fragments produits par la digestion de restriction de la séquence du gène 16S ARNr (RFLP) ou par comparaison de séquences d'ADN des régions de l'espaceur 16s / 23s^[8].

Des désaccords subsistent sur le nombre de groupes taxonomiques des phytoplasmes, des travaux faisant appel à la simulation par ordinateur des restrictions de digestion du gène 16S ARNr suggèrent qu'il pourrait y avoir jusqu'à 28 groupes^[9], tandis que d'autres articles plaident pour moins de groupes, mais plus de sous-groupes. Chaque groupe comprend au moins une espèce de "Candidatus Phytoplasma" caractérisée par des propriétés distinctives biologiques, phytopathologies et génétiques.

Quelques espèces et les maladies provoquées

Il existe selon LPSN (22 juin 2025)^[5] 74 espèces potentielles (moins sept espèces mal nommées et 4 espèces synonymes).

• Liste des espèces de "Ca. Phytoplasma", principaux groupes et sous-groupes publiés avec leurs noms communs et numéros d'accession GenBank de la séquence du gène 16S ARNr.

• Nota : les espèces de "Ca. Phytoplasma" indiquées entre crochets sont provisoires (similarité des séquence du 16S ARNr inférieure à 97,5 %) et non encore publiées séparément comme espèces nouvelles.
  « Indéterminé » indique les espèces de "Ca. Phytoplasma" pour lesquelles le classement dans un groupe ou sous-groupe est en attente.
  « Non assigné » indique les espèces de "Ca. Phytoplasma" dont le statut est en attente (similarité des séquence du 16S ARNr supérieure à 97,5 %) car les symptômes présentés par la plante ou l'insecte hôtes sont significativement différents lorsqu'ils sont infectés par la souche du phytoplasme décrite comparée à une souche de la même espèce ou du même groupe.

N°	Nom commun	Espèce de "Ca. Phytoplasma"	Groupe / sous-groupe	Numéro d'accession	Référence
1	Maladie d'Awka	[Ca. P. cocosnigeriae]	16Sr XXII-A	Y14175	Firrao, 2004
2	Tanzanian lethal disease	[Ca. P. cocostanzaniae]	indéterminé	X80117	Firrao, 2004
3	Loofah witches' broom	[Ca. P. luffae]	16Sr VIII-A	AF086621	Firrao, 2004
4	Jaunisse létale du palmier	[Ca. P. palmae]	16Sr IV-A	U18747	Firrao, 2004
5	Maladie X	[Ca. P. pruni]	16Sr III-A	L04682	Firrao, 2004
6	Stolbur	[Ca. P. solani]	16Sr XII-A	AF248959	Firrao, 2004
7	Flavescence dorée	[Ca. P. vitis]	16Sr V-C	AF176319	Firrao, 2004
8	Papaya yellow crinkle	Ca. P. aurantifolia	16Sr II-D	Y10097	Davis et al., 1997
9	Allocasuarina yellows	Ca. P. allocasuarinae	indéterminé	AY135523	Marcone et al., 2004
10	Flétrissement violacé de la pomme de terre	Ca. P. americanum	16Sr XVIII	DQ174122	Lee et al., 2006
11	Lime witches' broom	Ca. P. aurantifolia	16Sr II-B	U15442	Zriek et al., 1995
12	Jaunisse de la vigne	Ca. P. australience	16Sr XII	L76865	Davis et al., 1997
13	Balanites witches' broom	Ca. P. balanitae	16Sr V	AB689678	Win et al., 2012
14	Hibiscus witches' broom	Ca. P. brasiliense	16Sr XV	AF147708	Montano et al., 2001
15	Papaya bunchy top	Ca. P. caricae	16Sr XVII	AY725234	Arocha et al., 2005
16	Balai de sorcière du châtaignier	Ca. P. castaneae	16Sr XIX	AB054986	Jung et al., 2002
17	Jaunisse du liseron	Ca. P. convolvuli	16Sr XII	JN833705	Martini et al., 2012
18	Soybean stunt	Ca. P. costaricanum	16Sr XXXI	HQ225630	Lee et al., 2011
19	Feuilles blanches de la canne à sucre	Ca. P. cynodontis	16Sr XI	AB052874	Jung et al., 2003
20	Areca palm yellow leaf	Ca. P. cynodontis	16Sr XI-A	JN967909	Ramaswamy et al., 2012
21	Feuilles blanches de la canne à sucre	Ca. P. cynodontis	16Sr XI-C	X76432	Lee et al., 1998
22	Leafhopper bourne BVK	Ca. P. cynodontis	16Sr XIV	X76429	Semuller et al., 2004
23	Bermuda grass white leaf	Ca. P. cynodontis	16Sr XIV	AJ550985	Marcone et al., 2004
24	Cynodon white leaf	Ca. P. cynodontis	indéterminé	AF509321	Blanche et al., 2003
25	Sorghum grassy shoot	Ca. P. cynodontis	indéterminé	AF509324	Blanche et al., 2003
26	Sorghum grassy shoot	Ca. P. cynodontis	indéterminé	AF509325	Blanche et al., 2003
27	Balai de sorcière du fraisier	Ca. P. fragariae	16Sr XII-E	DQ086423	Valiunas et al., 2006
28	Jaunisse du frêne	Ca. P. fraxini	16Sr VII-A	AF092209	Griffiths et al., 1999
29	Sugarcane Yellow Leaf	Ca. P. graminis	16Sr XVI	AY725228	Arocha et al., 2005
30	Hydrangea phyllody	Ca. P. japonicum	16Sr XII-D	AB010425	Sawayanagi et al., 1999
31	Parsley leaf of tomato	Ca. P. lycopersici	indéterminé	EF199549	Arocha et al., 2007
32	Periwinkle phyllody	Ca. P. malasianum	16Sr XXXII	EU371934	Nejat et al., 2012
33	Prolifération du pommier	Ca. P. mali	16Sr X-A	AJ542541	Semuller et al., 2004
34	Cassia italica witches' broom	Ca. P. omanense	16Sr XXIX	EF666051	Saddy et al., 2008
35	Nanisme jaune du riz	Ca. P. oryzae	16Sr XI-A	D12581	Namba et al., 2009
36	Nanisme jaune du riz	Ca. P. oryzae	16Sr XI-A	AB052873	Jung et al., 2003
37	Almond lethal disease	Ca. P. phoenicium	16Sr IX-D	AF515636	Verdin et al., 2003
38	Pine shoot proliferation	Ca. P. pini	16Sr XXI	AJ632155	Schneider et al., 2005
39	Maladie X	Ca. P. pruni	16Sr III-A	JQ044393	Davis et al., 2012
40	European stone fruit	Ca. P. prunorum	16Sr X-F	AJ542544	Semuller et al., 2004
41	Dépérissement du poirier	Ca. P. pyri	16Sr X-C	AJ542543	Semuller et al., 2004
42	Buckthorn witches' broom	Ca. P. rhamni	16Sr XX	X76431	Marcone et al., 2004
43	Rubus stunt	Ca. P. rubi	16Sr V	AY197648	Maher et al., 2011
44	Bois noir	Ca. P. solani	16Sr XII	JQ730746	Quaglino et al., 2013
45	Spartium witches' broom	Ca. P. spartii	16Sr X-D	X92869	Marcone et al., 2004
46	Balai de sorcière de la passiflore	Ca. P. sudamericanum	16Sr III-V	GU292082	Davis et al., 2012
47	Balai de sorcière de la passiflore	Ca. P. sudamericanum	16Sr VI	GU292081	Davis et al., 2012
48	Salt cedar witches' broom	Ca. P. tamaricis	16Sr XXX	FJ432664	Zhao et al., 2009
49	Prolifération du trèfle	Ca. P. trifolii	16Sr VI-A	AY390261	Hiruki et al., 2004
50	Jaunisse de l'orme	Ca. P. ulmi	16Sr V-A	AY197655	Lee et al., 2004
51	Balai de sorcière du jujubier	Ca. P. ziziphi	16Sr V-B	AB052876	Jung et al., 2003
52	Jaunisse de l'aster	Ca. P. asteris	16Sr I	M30790	Lee et al., 2004
53	Virescence de la pervenche mexicaine	non assigné	16Sr XIII-A	AF248960	Wei et al. 2007
54	Bermuda grass white leaf	non assigné	16Sr XIV	AJ550984	Marcone et al., 2004
55	Jaunisse de la vigne (Grapevine yellow)	non assigné	16Sr XXIII-A	AY083605	Wei et al., 2007
56	Sorghum bunchy shoot	non assigné	16Sr XXIV-A	AF509322	Wei et al., 2007
57	Weeping tea witches' broom	non assigné	16Sr XXV-A	AF521672	Wei et al., 2007
58	Jaunisse de la canne à sucre	non assigné	16Sr XXVI-A	AJ539179	Wei et al., 2007
59	Jaunisse de la canne à sucre	non assigné	16Sr XXVII-A	AJ539180	Wei et al., 2007
60	Derbid phytoplasma	non assigné	16Sr XXVIII-A	AY744945	Wei et al., 2007
61	Chinaberry yellows	non assigné	indéterminé	AF495882	Wei et al., 2007