RacCS203

Le Coronavirus de chauve-souris RmYN02 lié au SRAS ou Bat SL-CoV-RmYN02 est une souche de coronavirus lié au syndrome respiratoire aigu sévère qui infecte la chauve-souris Rhinolophus acuminatus et qui a été prélevé dans des sites de Thaïlande. Cette souche a une similitude de 91,5 % avec le SARS-CoV-2 et est la plus proche de la souche RmYN02^[2],[3].

Bat SL-CoV-RmYN02

Classification

Domaine	Riboviria
Règne	Orthornavirae
Embr.	Pisuviricota
Classe	Pisoniviricetes
Ordre	Nidovirales
Sous-ordre	Cornidovirineae
Famille	Coronaviridae
Sous-famille	Orthocoronavirinae
Genre	Betacoronavirus
Sous-genre	Sarbecovirus
Espèce	SARSr-CoV

forme

Bat SL-CoV-RmYN02
 

Classification phylogénétique

Position :

• Espèce : SARSr-CoV (arbre résumé)
  • • • SARSr-CoV WIV1
      • SARSr-CoV RsSHC014
    • SARS-CoV-1 (agent du SRAS)
  • • SARSr-CoV RaTG13
    • SARS-CoV-2 (agent de la COVID-19)^[1]

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• Animal hôte :
• chauve-souris
• humain

Position phylogénétique

L'arbre phylogénétique de la branche des coronavirus apparentés au SARS-CoV-2, tel qu'obtenu sur la base du gène RdRp, est le suivant^[4],[5],[6] :

	Rc-o319, proche à 81 % du SARS-CoV-2, Rhinolophus cornutus, Iwate, Japon (récolté en 2013, publié en 2020)[7] SL-ZXC21, 88 %, Rhinolophus pusillus, Zhoushan, Zhejiang (récolté en 2015, publié en 2018)[8] SL-ZC45, 88 %, Rhinolophus pusillus, Zhoushan, Zhejiang (récolté en 2017, publié en 2018)[8] SL-CoV-GX, 89 %, Manis javanica, Asie du Sud-Est (récolté en 2017, publié en 2020)[9] SL-CoV-GD, 91 %, Manis javanica, Asie du Sud-Est[10] RacCS203, 91,5 %, Rhinolophus acuminatus, Chachoengsao, Thaïlande (métagénome de 4 coronavirus collectés en juin 2020, publié en 2021)[5] RmYN02, 93,3 %, Rhinolophus malayanus, Mengla, Yunnan (récolté en juin 2019, publié en 2020)[11] RpYN06, 94.4 %, Rhinolophus pusillus, Mengla, Yunnan (récolté en mai 2020, publié en 2021)[4] RshSTT182, 92,6 %, Rhinolophus shameli, Stoeng Treng, Cambodge (récolté en 2010, publié en 2021)[6] RaTG13, 96,1 %, Rhinolophus affinis, Mojiang, Yunnan (récolté en 2013, publié en 2020)[12] SARS-CoV-2 (100 %)
	SARS-CoV-1, proche à 79 % du SARS-CoV-2

• Animal hôte :
• chauve-souris
• pangolin
• humain

Voir aussi

• SARSr-CoV