Simple Modular Architecture Research Tool

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Simple Modular Architecture Research Tool, ou SMART, est une base de données bio-informatique utilisée pour l'identification et l'analyse de domaines protéiques au sein de séquences peptidiques[1],[2]. SMART utilise des modèles de Markov cachés construits à partir d'alignements de séquences multiples (en) afin de détecter des domaines protéiques sur ces séquences. La version de SMART publiée en 2012 contenait 1 009 modèles de domaines[3]. Les données de SMART ont été utilisées pour constituer la Conserved Domain Database et sont également distribuées au sein de la base de données InterPro[4].

SMART est hébergée par le Laboratoire européen de biologie moléculaire situé à Heidelberg, en Bade-Wurtemberg.

Notes et références

Annexes

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