CRuMs
eukarióta csoport From Wikipedia, the free encyclopedia
Remove ads
A CRuMs, más néven Crumalia[2] egysejtű eukarióták feltételezett kládja, melyek neve a következő rendek nevéből származik:[3][4]
- Collodictyonida (más néven Diphylleida vagy Diphyllatia),[5][6]
- Rigifilida (más néven Micronucleariida)[7] és
- Mantamonadida.[8]
A Mantamonas monofiletikus.[9]
Remove ads
Leírás
A CRuMs az Amorphea (a gombákat, az állatokat, az Amoebozoa és Apusomonadida csoportokat is tartalmazó taxon) testvérkládja.[10][11] A rajta kívül az Ancyromonadida rendet is tartalmazó korábbi Varisulca taxon legtöbb tagját tartalmazza. Ez azonban újabb filogenetikai elemzések szerint nem rokona az előbbi háromnak, és mivel bazálisabb, a Varisulca parafiletikus, vagyis nem monofiletikus, így nem ajánlott taxon.[12] Ugyanez igaz az Apusozoából és a Varisulcából álló Sulcozoa csoportra, melyet az Amorphea és CRuMs csoportja, a Podiata váltott le. Az alábbi taxonómia a Biotechnológiai Információk Nemzeti Központjáénak (NCBI) felel meg, nem a Globális Biodiverzitás Információs Megállapodásénak (GBIF), ahol a Sulcozoa a teljes taxon.
A CRuMs viszonylag kevés ismert fajjal rendelkező, de feltehetően nagy[11] csoport, melynek filogenetikai helyzete fontos, mivel a nagy csoportokon kívül van, így külcsoport, a filogenetikai fák „gyökere”.[13]
A CRuMs minden tagja rendelkezik bizonyos sejtplaszticitással: egyesek állábakat alkotnak.[12]
A Glissandra is tagja, de ennek helyzete ismeretlen.[14]
Remove ads
Filogenetika
| Orthokaryota |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Egy alternatív filogenetikai elemzés szerint az Ancyromonadida az Opimodában bazális helyzetű:[15]
| Opimoda |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Remove ads
Genomika
2023-ban Blaz et al. szekvenálták a Mantamonas sphyraenae genomját közel kromoszómaszinten. Ez a CRuMs elsőként szekvenált genomja, mérete 25,06 (a kiegészítő egységekkel együtt 31,49) Mbp, 78 (199) folytonos egységből áll, GC-tartalma 59,19%. A megfelelő transzkriptom 20,52 Mbp hosszú, 9255 folytonos egységből áll, GC-tartalma 59,02%.[9]
Transzkriptomikai úton 2024 szeptemberében Galindo et al. 3, a Diphylleiához és a Collodictyonhoz hasonló rejtett kládot fedeztek fel Dél-Csendes-óceánhoz közeli krátertavakban.[16]
Proteom
Ha a CRuMs és az Amorphea valóban egymás legközelebbi rokonai, közös ősük valószínűleg POP-ot használt mtDNS-e fenntartásához.[17] Az SR-B fehérjék ősi jellegét igazolja, hogy a Discoba, a Hemimastigophora s az Ancyromonadida mellett a CRuMs is rendelkezik ilyen velük.[18] A Holozoa egyes egysejtű ágaihoz hasonlóan Opa1-gyel, ezenkívül MidX/Mgm1 is megtalálható, így feltehetően a CRuMs és az Amorphea közös ősében jelen lehettek ezek, és egy vagy több tag elveszhetett a későbbi leszármazottakban.[19] A MidX gént az Opisthokontán belül csak egy galléros ostorosban találták meg.[19] Az Mgm1 Sheikh et al. 2023-as tanulmánya szerint erősen módosult MidX lehet, mert a Holomycota ősénél nem jelenhetett meg később – vagyis a MidX feltételezett elvesztése után kevéssel –, és a két fehérje közt közeli kapcsolat van.[19] Azonban a MidX nem rendelkezik a többi eukarióta DRP 1. zsanérjában megtalálható ősi jellegű kis α-hélixszel, vagyis a MidX Mgm1-gyé alakulásához ezen ősi állapotnak kell visszatérni, mely a fehérjék általános evolúciójához képest fordított irányú.[19]
A CRuMs Mgm1-e a humán OPA1-hez hasonlít, ez konvergens evolúció eredménye lehet.[19]
Horizontális géntranszfer
Dcd2-homológok találhatók egyes tagjaiban. A CRuMs és a vörösmoszatok Dcd2-szekvenciái az Amoebozoából származnak, ami eukarióták közt az Amoebozoából történő horizontális géntranszferre utalhat.[20] A CRuMs egyetlen Dcd1-gyel és Dcd2-vel rendelkező tagja a Diphylleia rotans lehet.[20]
Transz-splicing
A Diphylleia rotans volt a Chloroplastidán kívüli első élőlény, ahol II. csoportbeli intronok mediálta transz-splicingot észleltek, többek közt a 2 részre osztott cox2, nad3 és a 4 részre osztott cox1 génben.[21]
Remove ads
Jegyzetek
Fordítás
Wikiwand - on
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Remove ads