セクエストソーム-1

セクエストソーム-1(Sequestosome 1)は、ヒトではSQSTM1遺伝子がコードするタンパク質である^[5][6][7]。ユビキチン結合タンパク質p62とも呼ばれ^[8]、選択的オートファジーのために標的となる他のタンパク質と結合するオートファゴソームのカーゴタンパク質である。GATA4（英語版）と結合してこれを分解の標的とすると、GATA-4に関連する老化や細胞老化随伴分泌現象（英語版）を阻害することができる^[9]。

SQSTM1
PDBに登録されている構造 PDB オルソログ検索: RCSB PDBe PDBj PDBのIDコード一覧 1Q02, 2JY7, 2JY8, 2K0B, 2KNV, 4MJS, 4UF8, 4UF9
識別子
記号	SQSTM1, A170, OSIL, PDB3, ZIP3, p60, p62, p62B, FTDALS3, Sequestosome 1, NADGP, DMRV
外部ID	OMIM: 601530 MGI: 107931 HomoloGene: 31202 GeneCards: SQSTM1
遺伝子の位置 (ヒト) 染色体 5番染色体 (ヒト)[1] バンド データ無し 開始点 179,806,398 bp[1] 終点 179,838,078 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス) 染色体 11番染色体 (マウス)[2] バンド データ無し 開始点 50,090,193 bp[2] 終点 50,101,654 bp[2]
RNA発現パターン さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 • protein homodimerization activity • receptor tyrosine kinase binding • zinc ion binding • SH2 domain binding • 金属イオン結合 • protein serine/threonine kinase activity • K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding • 血漿タンパク結合 • identical protein binding • プロテインキナーゼ結合 • protein kinase C binding • ubiquitin binding • 酵素結合 • ubiquitin protein ligase binding • ionotropic glutamate receptor binding 細胞の構成要素 • 細胞質 • エンドソーム • PML body • late endosome • Pボディ • phagophore assembly site • 核質 • アグリソーム • オートファゴソーム • amphisome • 小胞体 • 封入体 • リソソーム • sperm midpiece • エキソソーム • cytoplasmic vesicle • 細胞核 • 細胞質基質 • 細胞内膜で囲まれた細胞小器官 • autolysosome • ミトコンドリア • サルコメア • レビー小体 生物学的プロセス • アポトーシス • タンパク質局在化 • 細胞分化 • positive regulation of protein phosphorylation • intracellular signal transduction • ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of mitochondrion organization • protein heterooligomerization • 免疫系プロセス • ストレスへの反応 • regulation of Ras protein signal transduction • negative regulation of apoptotic process • オートファジー • endosomal transport • regulation of protein complex stability • マイトファジー • positive regulation of apoptotic process • regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of transcription by RNA polymerase II • タンパク質リン酸化 • mitophagy • response to mitochondrial depolarisation • macroautophagy • endosome organization • protein localization to perinuclear region of cytoplasm • response to ischemia • mitochondrion organization • aggrephagy • selective autophagy • interleukin-1-mediated signaling pathway • positive regulation of long-term synaptic potentiation • positive regulation of protein localization to plasma membrane 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
種	ヒト	マウス
Entrez	8878	18412
Ensembl	ENSG00000161011 ENSG00000284099	ENSMUSG00000015837
UniProt	Q13501	Q64337
RefSeq (mRNA)	NM_001142298 NM_001142299 NM_003900	NM_001290769 NM_011018
RefSeq (タンパク質)	NP_001135770 NP_001135771 NP_003891	NP_001277698 NP_035148
場所 (UCSC)	Chr 5: 179.81 – 179.84 Mb	Chr 5: 50.09 – 50.1 Mb
PubMed検索	[3]	[4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト 閲覧/編集 マウス

モデル生物

SQSTM1遺伝子の機能の研究のためにモデル生物が用いられている。ハイスループットの突然変異誘発により病気の動物モデルを作り出し科学者に頒布するプロジェクトである国際ノックアウトマウスコンソーシアム（英語版）がSqstm1^{tm1a(KOMP)Wtsi[10][11]}と呼ばれるコンディショナルノックアウトマウスの系統を作り出している^[12][13][14]。

遺伝子欠損の効果を確認するために、規格化された表現型スクリーニングが雄雌の動物に対して行われた^[15][16]。22の試験がホモ接合変異マウスに対して行われ、そのうちの1つで重大な異常が観察された。メスは、赤血球分布幅の増加や平均血小板容積の増加等、全血球計算のパラメータが異常値を示した^[15]。

相互作用

セクエストソーム-1は、以下のタンパク質とタンパク質間相互作用する。

• MAP1LC3A（英語版）^[17]
• PRKCI（英語版）^[18]
• RAD23A（英語版）^[19]
• RIPK1^[20]
• TRAF6（英語版）^[21]
• TrkA（英語版）^{[22][23][24][25]}
• TrkB^[23][24]
• Nrf2（英語版） ^[26]