フィラミンA

フィラミンA（filamin A）は、ヒトではFLNA遺伝子によってコードされているタンパク質である^[5][6]。

FLNA
PDBに登録されている構造 PDB オルソログ検索: RCSB PDBe PDBj PDBのIDコード一覧 2AAV, 2BP3, 2BRQ, 2J3S, 2JF1, 2K3T, 2K7P, 2MTP, 2W0P, 2WFN, 3CNK, 3HOC, 3HOP, 3HOR, 3ISW, 3RGH, 4M9P, 4P3W
識別子
記号	FLNA, ABP-280, ABPX, CSBS, CVD1, FLN, FLN-A, FLN1, FMD, MNS, NHBP, OPD, OPD1, OPD2, XLVD, XMVD, filamin A, FGS2
外部ID	OMIM: 300017 MGI: 95556 HomoloGene: 1119 GeneCards: FLNA
遺伝子の位置 (ヒト) 染色体 X染色体[1] バンド データ無し 開始点 154,348,524 bp[1] 終点 154,374,634 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス) 染色体 X染色体 (マウス)[2] バンド データ無し 開始点 73,267,067 bp[2] 終点 73,293,426 bp[2]
RNA発現パターン さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 • protein homodimerization activity • protein-containing complex binding • 転写因子結合 • mu-type opioid receptor binding • シグナルトランスデューサー活性 • actin filament binding • small GTPase binding • キナーゼ結合 • actin binding • SMAD binding • Fc-gamma receptor I complex binding • G protein-coupled receptor binding • GTPase binding • RNA結合 • potassium channel regulator activity • transmembrane transporter binding • cadherin binding • 血漿タンパク結合 細胞の構成要素 • 細胞質 • 膜 • 焦点接着 • cortical cytoskeleton • 細胞膜 • Myb complex • dendritic shaft • 細胞外領域 • soma • 細胞皮質 • 核小体 • マイクロフィラメント • actin cytoskeleton • perinuclear region of cytoplasm • エキソソーム • 細胞骨格 • 細胞核 • 尖端樹状突起 • filamentous actin • 細胞外マトリックス • cell-cell junction • 細胞質基質 • Z discdkac 生物学的プロセス • actin cytoskeleton reorganization • negative regulation of transcription by RNA polymerase I • negative regulation of protein catabolic process • タンパク質局在化の確立 • タンパク質の安定化 • platelet degranulation • mRNA transcription by RNA polymerase II • negative regulation of apoptotic process • receptor clustering • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • cytoplasmic sequestering of protein • platelet activation • mitotic spindle assembly • positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • protein localization to cell surface • cell projection organization • adenylate cyclase-inhibiting dopamine receptor signaling pathway • actin crosslink formation • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • positive regulation of integrin-mediated signaling pathway • platelet aggregation • cell junction assembly • regulation of cell migration • wound healing, spreading of cells • semaphorin-plexin signaling pathway • formation of radial glial scaffolds • 大脳皮質発生 • cilium assembly • protein localization to plasma membrane • positive regulation of potassium ion transmembrane transport • regulation of membrane repolarization during atrial cardiac muscle cell action potential • regulation of membrane repolarization during cardiac muscle cell action potential • positive regulation of neural precursor cell proliferation • positive regulation of neuron migration 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
種	ヒト	マウス
Entrez	2316	192176
Ensembl	ENSG00000196924	ENSMUSG00000031328
UniProt	P21333,H0Y5F3	Q8BTM8
RefSeq (mRNA)	NM_001110556 NM_001456	NM_001290421 NM_010227
RefSeq (タンパク質)	NP_001104026 NP_001447	NP_001277350 NP_034357 NP_001390993
場所 (UCSC)	Chr X: 154.35 – 154.37 Mb	Chr X: 73.27 – 73.29 Mb
PubMed検索	[3]	[4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト 閲覧/編集 マウス

機能

フィラミンは約280 kDaのアクチン結合タンパク質であり、細胞皮質においてアクチンフィラメントを架橋して直交するネットワークを形成し、またアクチン骨格の膜タンパク質への係留にも関与している。細胞骨格の再編成は細胞の形状や遊走の調節に中心的役割を果たしている。FLNA遺伝子にコードされるフィラミンAは幅広く発現しているフィラミンであり、インテグリン、膜貫通受容体複合体やセカンドメッセンジャーと相互作用してアクチン骨格の再編成を調節している^[7]。FLNA遺伝子には疾患の原因となる変異が少なくとも31種類発見されている^[8]。

構造

フィラミンAには、N末端のアクチン結合ドメイン、24個のIg様リピート、2つのヒンジ領域から構成される^[9][10]。

相互作用

フィラミンAは次に挙げる因子と相互作用することが示されている。

• BRCA2^[11]
• CD29（英語版）^[12][13]
• CASR^[14][15]
• FBLIM1（英語版）^[16]
• FILIP1（英語版）^[17]
• FLNB（英語版）^[18]
• NPHP1（英語版）^[19]
• RALA（英語版）^[20]
• SH2B3（英語版）^[21]
• TRIO（英語版）^[22]
• VHL^[23][24]

RNA編集

FLNAのpre-mRNAには1か所、アデノシンからイノシンへのRNA編集部位が存在する。この編集部位は最終的なタンパク質の2341番目のアミノ酸に相当する。編集部位でのアデノシンの特異的な脱アミノ化によって、コドンはグルタミン（Q）からアルギニン（R）へ変化する。編集領域は約200ヌクレオチド下流に位置する相補性配列（ECS）と32塩基対の二本鎖を形成することが予測されている。このECSはイントロン配列中に存在する^[25]。このQ/R部位の編集にはADAR1とADAR2（英語版）の双方が関与している可能性が高い。マウスでは、Adar1のノックアウトではQ/R部位の編集に影響はみられず、Adar2のノックアウトによってわずかに減少する。Adar1とAdar2のダブルノックアウトでは編集はみられなくなる^[26]。

編集を受けるアデノシンは22個のIg様リピートをコードする領域に位置している。この領域は、インテグリンβ鎖結合ドメインであり^[27]、RAC1結合ドメインでもある^[20]。アミノ酸の変化は結合ドメインの静電ポテンシャルに影響を及ぼし^[25]、多くのタンパク質への結合に影響を及ぼしている可能性が高い^[28]。FLNAの編集部位はGRIA2（GluR2）のR/G部位と同様にスプライス部位から2ヌクレオチドの位置にあり、どちらの転写産物も編集部位周辺のヌクレオチドは7/8が同一である。GRIA2のR/G部位の編集はスプライシングに影響を及ぼすと考えられており、両者の配列や編集部位の類似性はFLNAの編集もスプライシングを調節している可能性があることを意味している。GRIA2に関するin vitroでの実験では、ADAR2の存在によってスプライシングの阻害が引き起こされることが示されている^[29]。FLNAに関するESTデータの解析では、最終エクソンの編集とその後のイントロン配列の保持との関連が示されている^[25]。

DNA修復

フィラミンAとBRCA1タンパク質のとの相互作用は、DNA修復過程の初期段階の効果的調節に必要である^[30]。フィラミンAは相同組換えや非相同末端結合といったDNA修復過程の制御への関与が示唆されている^[30]。