哺乳類天然記念物一覧

哺乳類天然記念物一覧は、日本の文部科学大臣が指定する天然記念物（特別天然記念物を含む、以下同）のうち、哺乳類に関するもののリスト。ここでは、天然記念物指定基準「動物」に基づき指定された天然記念物のうち、哺乳類の種および生息地、繁殖地等に関連するものを掲載する。なお、本項では国（日本国文部科学大臣）指定の天然記念物を扱い、地方自治体指定の天然記念物は対象外とする。

特別天然記念物

いずれも種指定

• アマミノクロウサギ
• イリオモテヤマネコ
• カモシカ
• カワウソ

天然記念物

「種指定」と注記のないものは、棲息地、繁殖地、品種等の指定。

• アブラコウモリ
  • 西湖蝙蝠穴およびコウモリ（山梨県）
• 日本犬
  • 秋田犬、甲斐犬、紀州犬、越の犬（1971年絶滅）、柴犬、土佐犬^[1]、北海道犬
• ウサギコウモリ
  • 岩泉湧窟及びコウモリ（岩手県）
  • 西湖蝙蝠穴およびコウモリ（山梨県）
• ウシ
  • 見島ウシ産地（山口県・萩市）
• ウマ
  • 岬馬およびその繁殖地（宮崎県・串間市）
• オガサワラオオコウモリ（種指定）
• キクガシラコウモリ
  • 岩泉湧窟及びコウモリ（岩手県）
  • 西湖蝙蝠穴およびコウモリ（山梨県）
• クビワオオコウモリ
  • エラブオオコウモリ（亜種指定）
  • ダイトウオオコウモリ（亜種指定）
• コキクガシラコウモリ
  • 岩泉湧窟及びコウモリ（岩手県）
  • 西湖蝙蝠穴およびコウモリ（山梨県）
• ケナガネズミ（種指定）
• ジュゴン（種指定）
• スナメリ
  • スナメリクジラ廻游海面（広島県）
• タヌキ
  • 向島タヌキ生息地
• ツシマテン（種指定）
• ツシマヤマネコ（種指定）
• テングコウモリ
  • 岩泉湧窟及びコウモリ（岩手県）
• トゲネズミ（種指定）（以下の3つは、現在は亜種でなく別個の種と考えられている）
  • オキナワトゲネズミ
  • アマミトゲネズミ
  • トクノシマトゲネズミ
• ニホンカモシカ
  • 笠堀のカモシカ生息地（新潟県）
• ニホンザル
  • 下北半島のサルおよびサル生息北限地（青森県）
  • 高崎山のサル生息地（大分県）
  • 箕面山のサル生息地（大阪府）
  • 臥牛山のサル生息地（岡山県）
  • 高宕山のサル生息地（千葉県）
  • 幸島サル生息地（宮崎県）
• ニホンジカ
  • ケラマジカおよびその生息地（沖縄県・座間味村）
  • 奈良のシカ
• モモジロコウモリ
  • 岩泉湧窟およびコウモリ（岩手県）
• ヤマネ（種指定）
• ユビナガコウモリ
  • 大吼谷蝙蝠洞（山口県下関市）

• 群集
  • 龍河洞（高知県香美市）：小型コウモリ類が生息。