2006년 한국프로야구 신인 드래프트

2006년 한국프로야구 신인선수 지명회의에서 1차 지명은 지역연고 지명이었고, 2차 지명 회의는 2005년 8월 31일 서울 양재동 교육문화회관에서 있었다.

1차 지명

구단	출신학교	포지션	성명	입단계약일	입단계약조건	비고
현대 유니콘스	연고지없음으로 1차 지명권 없음
삼성 라이온즈	경주고(유급) - 건국대	투수	김효남	2005. 10. 5	계약금 1억 5천만 원, 연봉 2천만 원	경주고 시절 1년간 유급
두산 베어스	신일고	투수	남윤성
KIA 타이거즈	광주동성고	투수	한기주	2005. 5. 8	계약금 10억 원, 연봉 2천만 원	역대 고졸 최고 계약금
SK 와이번스	인천고	포수	이재원	2005. 6. 8	계약금 2억 5천만 원, 연봉 2천만 원
LG 트윈스	경기고 - 경성대	투수	김기표	2005. 6. 8	계약금 2억 1천만 원, 연봉 2천만 원
한화 이글스	북일고	투수	유원상	2005. 8. 19	계약금 5억 5천만 원(옵션 1억 5천), 연봉 2천만 원
롯데 자이언츠	부산고	내야수	손용석	2005. 6. 26	계약금 1억 원, 연봉 2천만 원

2차 지명

2차 지명 순위는 2004년 시즌 순위의 역순으로 정해졌다.

※이름에 가로줄이 그어진 것은 구단이 해당 선수에 대한 지명권을 포기했음을 의미함.

지명 순위	롯데	한화	LG	SK	KIA	두산	삼성	현대
1	나승현 (광주일고,투수)	류현진 (동산고,투수)	신창호 (경동고,투수)	김성훈 (인천고,투수)	손영민 (청주기공,투수)	김건국 (덕수고,투수)	차우찬 (군산상고,투수)	강정호 (광주일고,포수)
2	김정환 (경남대,투수)	양승진 (춘천고,투수)	원종현 (군산상고,투수)	홍명찬 (한서고,내야)	박정규 (경희대,투수)	민병헌 (덕수정보,외야)	김상수 (신일고,투수)	김세현 (덕수정보,투수)
3	김문호 (덕수정보,외야)	정범모 (청주기공,포수)	윤동건 (속초상고,투수)	김성현 (광주일고,내야)	박경태 (동산고,투수)	박성남 (동성고,내야)	김기태 (동산고,투수)	황재균 (경기고,내야)
4	배장호 (유신고,투수)	신해수 (화순고,투수)	황선일 (군산상고,외야)	김용태 (인천고,투수)	이해창[1] (경기고,포수)	송영찬 (경북고,내야)	장준환 (동성고,외야)	조용훈 (성남고,투수)
5	김유신 (경남고,투수)	장병탁 (성균관대,투수)	김영롱 (인천고,투수)	김재현 (원주고,외야)	김준무 (서울고,내야)	유상우 (효천고,내야)	고관성 (주엽고,투수)	신현철 (유신고,외야)
6	황동채 (성균관대,외야)	임기범 (성남고,포수)	박영주 (휘문고,투수)	김남영 (천안북일,외야)	변강득 (용마고,투수)	최주환 (동성고,내야)	모상기 (신일고,내야)	유선정 (상원고,포수)
7	박상흠 (경남고,투수)	김성환[2] (경희대,내야)	최승준 (동산고,포수)	김태훈 (대구고,포수)	박경진 (춘천고,포수)	홍병오 (송원대,투수)	김현준 (탐라대,투수)	유재신 (천안북일,내야)
8	이진혁 (동아대,내야)				이성준 (경희대,외야)	양의지 (진흥고,포수)	현철민 (덕수정보,포수)	이정신 (단국대,투수)
9	홍유택 (건국대,내야)			이명기 (인천고,외야)		박진원 (신일고,외야)	김창호[3] (진흥고,외야)	김동진 (부경고,투수)