세종특별자치시교육청(世宗特別自治市敎育廳, Sejong City Office of Education)은 대한민국 세종특별자치시의 교육에 관한 사무를 담당하는 지방교육행정기관이다. 2012년 세종특별자치시의 출범과 함께 대한민국의 17번째 시·도교육청으로 설립되었으며, 시·도교육청 중 최초의 단층형 교육청이다. 세종특별자치시교육감은 차관급 지방교육직공무원으로 보한다. 세종특별자치시 한누리대로 2154에 위치해 있다.