세종특별자치시선거관리위원회(世宗特別自治市選擧管理委員會)는 대한민국 중앙선거관리위원회 소속 기관으로 세종특별자치시 출범으로 연기군선거관리위원회가 폐지됨과 동시에 설립되었다. 세종특별자치시선거관리위원회의 위원은 국회의원의 선거권이 있고 정당원이 아닌 자 중에서 국회에 교섭단체를 구성한 정당이 추천한 사람과 당해 지역을 관할하는 지방법원장이 추천하는 법관 2인을 포함한 3인과 교육자 또는 학식과 덕망이 있는 자 중에서 3인을 중앙선거관리위원회가 위촉하며, 위원장은 당해 선거관리위원회위원 중에서 호선한다. 세종특별자치시 연서면에 위치하고 있다.