Mendelian Inheritance in Man

Mendelian Inheritance in Man, MIM; wersja elektroniczna Online Mendelian Inheritance in Man, OMIM – baza danych o wszystkich opisanych chorobach uwarunkowanych genetycznie występujących u człowieka. Projekt ma na celu gromadzenie informacji o fenotypach chorobowych, i gdy to możliwe, genach których mutacje są wiązane z wystąpieniem określonych schorzeń.

Historia

Baza danych Mendelian Inheritance in Man została zapoczątkowana na początku lat 60. XX wieku przez dr Victora A. McKusicka z Johns Hopkins University i systematycznie rozszerzana. Wydawano ją w formie książkowej i w latach 1966–1998 ukazało się 12 edycji tego wydawnictwa. W roku 1987 udostępniono wersję elektroniczną pod nazwą Online Mendelian Inheritance in Man™ (OMIM™), która w roku 1995 stała się dostępna w Internecie za sprawą NCBI (National Center for Biotechnology Information). Jest ona dostępna za pośrednictwem wyszukiwarki Entrez na stronie National Library of Medicine.

Opracowywanie informacji

Informacje dostępne w bazie są zbierane i przetwarzane przez zespół naukowców kierowany przez pomysłodawcę i twórcę projektu, Victora McKusicka z Johns Hopkins University, choć ważny jest również wkład nadsyłany przez naukowców rozsianych po całym świecie. Odpowiednie artykuły są kolejno tworzone, dyskutowane i w standardowej formie udostępniane w bazie danych.

Klasyfikacja

Każda choroba i każdy gen mają przypisany sześciocyfrowy kod. Pierwsza cyfra kodu wskazuje na typ dziedziczenia choroby albo genu. Cyfra 1 wskazuje na autosomalnie dominujący, a 2 autosomalnie recesywny typ dziedziczenia; choroby i geny związane z chromosomem X mają kod rozpoczynający się cyfrą 3. Poszczególne choroby lub geny z 12. edycji Mendelian Inheritance in Man mają przypisany sześciocyfrowy kod podany w kwadratowych nawiasach, poprzedzony lub nie gwiazdką (*). Symbol ten wskazuje na znany typ dziedziczenia choroby lub genu. Symbol # przed pozycją oznacza, że fenotyp choroby może być spowodowany mutacją w więcej niż jednym genie; przykładowo, zespół Pelizaeusa-Merzbachera [MIM*169500] jest chorobą o udowodnionym autosomalnie dominującym typie dziedziczenia spowodowanym mutacją w jednym genie.

Pierwsza cyfra kodu	Przedział kodów	Typ dziedziczenia
1	100000-199999	Autosomalnie dominujące (pozycje utworzone przed 15 maja 1994)
2	200000-299999	Autosomalnie recesywne (pozycje utworzone przed 15 maja 1994)
3	300000-399999	Związane z chromosomem X
4	400000-499999	Związane z chromosomem Y
5	500000-599999	Związane z genomem mitochondrialnym
6	600000-	Autosomalne (pozycje utworzone po 15 maja 1994)

Statystyki

Statystyki bazy OMIM^[1]

Kategoria	Autosomalne	Związane z X	Związane z Y	Mitochondrialne	Wszystkie
* Geny o znanej sekwencji	11098	508	48	37	11692
+ Geny o znanej sekwencji i wywoływanym fenotypie	350	31	0	0	381
# Znany fenotyp i podstawy molekularne	1941	179	2	26	2148
% Znany fenotyp choroby o dziedziczeniu mendlowskim lub locus, nieznane podstawy molekularne	1462	133	4	0	1599
Inne, głównie fenotypy o przypuszczalnym dziedziczeniu mendlowskim	1983	143	2	0	2128
Razem	16834	994	56	63	17948

Wyszukiwanie informacji

Wyszukiwanie informacji w OMIM można przeprowadzać według: numeru MIM, nazwy choroby, nazwy genu, a także zapytaniach języka naturalnego (po angielsku).

W haśle chorób genetycznych w bazie OMIM zawarte są m.in. następujące informacje:

• synonimy (nazw genu lub choroby),
• opis schorzenia,
• podsumowanie kliniczne,
• rodzaj dziedziczenia,
• informacje cytogenetyczne,
• lokalizacja chromosomalna,
• rozpoznanie,
• patogeneza,
• zmienność genetyczne,
• piśmiennictwo.

Podane są także linki do różnych bioinformatycznych baz danych.