Нуклеотидная последовательность

Нуклеотидная последовательность, генетическая последовательность — порядок следования нуклеотидных остатков в нуклеиновых кислотах. Определяется при помощи секвенирования.

Нуклеотидная последовательность
Следующее по порядку	вторичная структура нуклеиновой кислоты[вд]
Код NCI Thesaurus	C45374
Медиафайлы на Викискладе

Распечатка электрофореграммы, полученной с помощью автоматического секвенатора

Описание

Для записи нуклеотидных последовательностей ДНК по рекомендации IUPAC используются символы латинского алфавита.^[1]

• A = аденин^[2]
• C = цитозин
• G = гуанин
• T = тимин
• R = G A гуанин или аденин — пуриновые (purine) основания
• Y = T C пиримидиновые (pyrimidine) основания
• K = G T содержащие кето-группу
• M = A C содержащие аминогруппу
• S = G C «сильные» (strong), образующие 3 водородные связи
• W = A T «слабые» (weak), образующие 2 водородные связи
• B = G T C (любой, кроме A)
• D = G A T (любой, кроме C)
• H = A C T (любой, кроме G)
• V = G C A (любой, кроме T)
• N = A G C T (любой)

Символы, обозначающие неопределённость последовательности, необходимы, когда точная последовательность неизвестна, несущественна или известны разные её варианты.

Для записи последовательностей РНК обычно достаточно символов A, С, G, U (уридин).

Все последовательности записываются без пробелов, слева направо, от 5'-конца к 3'-концу.

См. также

• Однонуклеотидный полиморфизм
• Консервативные мотивы
• Первичная структура