Brachyury

Brachyury — белок, который кодируется геном Т, эмбриональный транскрипционный фактор. Входит в семейство белков с Т-боксом, играет важную роль в эмбриогенезе трехслойных животных.

T brachyury transcription factor
PDB rendering based on 1xbr.
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB 1xbr
Идентификаторы
Символ	T ; SAVA; TFT
Внешние ID	OMIM: 601397 MGI: 98472 HomoloGene: 2393 GeneCards: Ген T
Генная онтология Функция • RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription factor binding • RNA polymerase II activating transcription factor binding • transcriptional repressor activity, RNA polymerase II transcription factor binding • transcription factor activity, sequence-specific DNA binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding Компонент клетки • nuclear chromatin • nucleus • cytoplasm Биологический процесс • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter • vasculogenesis • somitogenesis • neural plate morphogenesis • neural tube closure • heart morphogenesis • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter involved in myocardial precursor cell differentiation • transcription, DNA-templated • signal transduction • penetration of zona pellucida • mesoderm development • mesoderm migration involved in gastrulation • positive regulation of cell proliferation • anterior/posterior axis specification, embryo • notochord formation • signal transduction involved in regulation of gene expression • BMP signaling pathway • post-anal tail morphogenesis • embryonic skeletal system development • canonical Wnt signaling pathway • bone morphogenesis • SMAD protein signal transduction • determination of heart left/right asymmetry • cellular response to retinoic acid • primitive streak formation Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Вид	Человек	Мышь
Entrez	6862	20997
Ensembl	ENSG00000164458	ENSMUSG00000062327
UniProt	O15178	P20293
RefSeq (мРНК)	NM_001270484	NM_009309
RefSeq (белок)	NP_001257413	NP_033335
Локус (UCSC)	Chr 6: 166.16 – 166.17 Mb	Chr 17: 8.43 – 8.44 Mb
Поиск в PubMed	Искать	Искать

История открытия

Мутацию brachyury у мышей описала французский генетик Надежда Добровольская в 1927 году^[1]. Гетерозиготы по этой мутацией имели укороченный хвост и крестцовый отдел позвоночника, тогда как гомозиготы погибали ещё до рождения. Название происходит от греческого βράχυς brachys — короткий, и ούρα oura — хвост. Мутация была доминантной, но Добровольская считала, что она связана с потерей функции белка, что и подтвердилось позже.

Белок клонирован в 1990 году. Это оказался эмбриональный транскрипционный фактор длиной в 436 аминокислотных остатков. Он присоединяется с помощью специальной последовательности на N-конце (Т-бокса) к регуляторной последовательности нуклеотидов ДНК TCACACCT^[2].

Функция

Экспрессия Brachyury у CD1-мышей на 7,5 день после оплодотворения

Ген транскрибируется у мышей в бластоцисте и при гаструляции. Белок определяет формирование центральной оси тела, хорды, мезодермы, бластопора.

Распространение

Раньше считалось, что Т-ген имеется только у трехслойных животных. В дальнейшем гены с Т-боксом были найдены у кишечнополостных и губок. В 2010 году гомолог Т-гена был описан у амёб, а позже у многих одноклеточных, относящихся к группе Opisthokonta. Т-ген амёбы, который пересадили зародышу шпорцевой лягушки, был способен выполнять нужную функцию.^[3]

Патология

Brachyury имеет высокий уровень экспрессии в некоторых раковых опухолях.