NAMD

NAMD (NAnoscale Molecular Dynamics) — бесплатная программа для молекулярной динамики, написанная с использованием модели параллельного программирования Charm++, обладающей высокой эффективностью распараллеливания и часто используемой для симуляции больших систем (миллионы атомов). Программа была создана совместно Группой Теоретической и Вычислительной Биофизики (TCB) и Лабораторией параллельного программирования (PPL) из Иллинойсского университета в Урбане и Шампейне.

NAMD
Тип	химическое программное обеспечение[вд]
Разработчик	Иллинойсский университет в Урбане и Шампейне
Написана на	C++
Операционная система	Кроссплатформенный
Последняя версия	2.10 (11 декабря 2014)[1] 3.0.1 (14 октября 2024)[2]
Репозиторий	gitlab.com/tcbgUIUC/namd
Сайт	ks.uiuc.edu/Research/nam…
Медиафайлы на Викискладе

Программа была анонсирована в 1995 г Нэльсоном и др.^[3] как параллельная программа для молекулярной динамики, включающая интерактивное моделирование, связанное с программой визуализации VMD. Программа поддерживает мультипроцессорность, возможность использовать для расчетов графические процессоры (технология CUDA).

См. также

• CHARMM
• GROMACS
• VMD
• Charm++
• LAMMPS