Pfam

From Wikipedia, the free encyclopedia

Remove ads

Pfam je baza podataka proteinskih familija koja sadrži njihove anotacije i poravnavanja višestrukih sekvenci generisane koristeći skrivene Markovljeve modele.[1][2][3]

Osobine

Za svaku familiju u Pfam bazi podata je moguće:

  • Pregledati višestruka poravnavanja
  • Prikazati arhitekture proteinskih domena
  • Pregledati vrste distribucija
  • Slediti linkove prema drugim bazama podataka
  • Prikaziti poznate proteinske strukture

74% proteinskih sekvenci imaju bar jednu Pfam vezu.[4] Taj broj se naziva pokrivenost sekvenci.

Povezano

Literatura

Loading related searches...

Wikiwand - on

Seamless Wikipedia browsing. On steroids.

Remove ads