RNK polimeraza

RNK polimeraza (RNAP, RNApol, DNK zavisna RNK polimeraza) je enzim koji formira RNK. U ćelijama, RNAP je neophodna za formiranje RNK lanaca koristeći DNK gene kao templete u procesu transkripcije. RNK polimeraze su esencijalne za život i prisutne su u svim organizmima i mnogim virusima. U hemijskom smislu, RNAP je nukleotidil transferaza koja polimerizuje ribonukleotide na 3' kraju RNK transkripta.^[1]

RNK polimeraza
Identifikatori
EC broj	2.7.7.6
CAS broj	9014-24-8
IntEnz	IntEnz view
BRENDA	BRENDA entry
ExPASy	NiceZyme view
KEGG	KEGG entry
MetaCyc	metabolic pathway
PRIAM	profile
PDB	RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum
Ontologija gena	AmiGO / EGO
Pretraga PMC articles PubMed articles NCBI Protein search

Historija

RNAP su nezavisno otkrili Samuel B. Ves, Odri Stevens, i Džerard Harvitc 1960.^[2] Do tog vremena polovina Novelove nagrade za medicinu (1959.) je bila dodeljena Severo Očoi za otkriće enzima za koji se smatralo da je RNAP,^[3] ali se kasnije ispostavilo da je polinukleotidna fosforilaza.

Nobelova nagrada za hemiju 2006. je dodeljena Rodžeru D. Kornbergu za kreiranje detaljne molekulske slike RNK polimeraze tokom raznih stupnjeva transkripcionog procesa.^[4]

Kontrola transkripcije

Elektronska mikrografija DNK lanca sa stotinama RNAP molekula koji su suviše mali da bi se jasno videli.

Kontrola procesa genske transkripcije utiče na obrasce ekspresije gena i, stoga omogućava ćeliji da se adaptira na promene sredine, obavlja specijalizovane uloge u organizmu, i održava osnovne metaboličke procese neophodne za opstanak. Iz tog razloga aktivnost RNAP je dugotrajna, kompleksna i visoko regulisana. U bakteriji Escherichia coli, postoji više od 100 transkripcionih faktora koji modifikuju aktivnost RNAP je bilo identifikovano.^[5]

RNAP može da inicira transkripciju na specifičnim DNK sekvencama poznatim kao promoteri. Ona zatim proizvodi RNK lanac, koji je komplementaran sa templetom DNK lanca. Proces dodavanja nukleotida na RNK lanaca je poznat kao produžavanje. Kod eukariota, RNAP može da formira lance sa 2.4 miliona nukleotida (puna dužina gena distrofina). RNAP preferentno otpušta svoj RNK transkript na specifičnim DNK sekvencama kodiranim na kraju gena, poznatim kao terminatori.

RNAP produkti su:

• Informaciona RNK (iRNK) - templet za sintezu proteina ribozomima.
• Nekodirajuća RNK ili RNK geni - široka klasa gena koji kodiraju RNK, koja se ne translira u protein. Najprominentniji primeri RNK gena su transportna RNK (tRNK) i ribozomalna RNK (rRNK), koje učestvuju u procesu translacije. Međutim od 1990-tih, mnogi novi RNK geni su nađeni, tako da RNK geni mogu da imaju mnogo značajniju ulogu nego što je ranije bilo poznato.
  • Transfer RNK (tRNK) - prenosi specifične aminokiseline na rastuće polipeptidne lance na ribozomalnom mestu proteinske sinteze tokom translacije
  • Ribozomalna RNK (rRNK) - komponenta ribozoma
  • Mikro RNK - reguliše gensku aktivnost
  • Katalitička RNK (Ribozim) - enzimatski aktivni RNK molekuli